如何按中位数对熊猫的箱线图进行排序?

时间:2014-02-20 15:43:07

标签: python pandas boxplot

我想在数据框Z中按类别dfX绘制一个列Y的箱线图。如何按中位数按降序对箱线图进行排序?

import pandas as pd
import random
n = 100
# this is probably a strange way to generate random data; please feel free to correct it
df = pd.DataFrame({"X": [random.choice(["A","B","C"]) for i in range(n)], 
                   "Y": [random.choice(["a","b","c"]) for i in range(n)],
                   "Z": [random.gauss(0,1) for i in range(n)]})
df.boxplot(column="Z", by=["X", "Y"])

请注意this question非常相似,但它们使用不同的数据结构。我对pandas比较陌生(并且一般只在python上做了一些教程),所以我无法弄清楚如何使我的数据与那里发布的答案一起工作。这可能更像是重塑而不是绘图问题。也许有使用groupby的解决方案?

4 个答案:

答案 0 :(得分:10)

您可以使用How to sort a boxplot by the median values in pandas中的答案,但首先需要对数据进行分组并创建新的数据框:

import pandas as pd
import random
import matplotlib.pyplot as plt

n = 100
# this is probably a strange way to generate random data; please feel free to correct it
df = pd.DataFrame({"X": [random.choice(["A","B","C"]) for i in range(n)], 
                   "Y": [random.choice(["a","b","c"]) for i in range(n)],
                   "Z": [random.gauss(0,1) for i in range(n)]})
grouped = df.groupby(["X", "Y"])

df2 = pd.DataFrame({col:vals['Z'] for col,vals in grouped})

meds = df2.median()
meds.sort(ascending=False)
df2 = df2[meds.index]
df2.boxplot()

plt.show()

plot

答案 1 :(得分:10)

与Alvaro Fuentes相似answer'以功能形式提供更多便携性

import pandas as pd

def boxplot_sorted(df, by, column):
  df2 = pd.DataFrame({col:vals[column] for col, vals in df.groupby(by)})
  meds = df2.median().sort_values()
  df2[meds.index].boxplot(rot=90)

boxplot_sorted(df, by=["X", "Y"], column="Z")

答案 2 :(得分:5)

要回答标题中的问题,而无需解决绘制两个分类变量的所有组合的额外细节:

n = 100
df = pd.DataFrame({"Category": [np.random.choice(["A","B","C","D"]) for i in range(n)],      
                   "Variable": [np.random.normal(0, 10) for i in range(n)]})

grouped = df.loc[:,['Category', 'Variable']] \
    .groupby(['Category']) \
    .median() \
    .sort_values(by='Variable')

sns.boxplot(x=df.Category, y=df.Variable, order=grouped.index)

enter image description here

我添加了此解决方案,因为很难将可接受的答案简化为单个变量,而且我敢肯定人们正在寻找一种方法来做到这一点。我本人曾多次问这个问题,以寻求这样的答案。

答案 3 :(得分:0)

我遵循了已接受的答案,但是当我想覆盖使用另一个 y 轴(即 ax.twinx())的第二个图时遇到了麻烦。问题是第二个图的 x 轴覆盖了排序顺序。

我最终只用 seaborn 完成了以下操作。这类似于@rocksNwaves 的回答,但我是用问题引入的术语来写的。 只需三步:

  1. 如果您不介意创建一个包含“X”和“Y”的列,那么使用 seaborn 会让事情变得更容易:

    df["XY"] = df["X"] + df["Y"]
    

    当然,您可以按照您想要的任何方式组合这两列。

  2. 按XY排序并获得排序索引

    grouped = df.groupby(["XY"])
    order = grouped.median()["Z"].sort_values().index
    
  3. 使用 seaborn 绘图

    sns.boxplot(x="XY", y="Z", data=df, order=order)
    

    请注意,您可以将 order 视为指定标签在 x 轴上的顺序。

一个完整的程序:

import pandas as pd
import random
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt
n = 100
# this is probably a strange way to generate random data; please feel free to correct it
df = pd.DataFrame({"X": [random.choice(["A","B","C"]) for i in range(n)],
                   "Y": [random.choice(["a","b","c"]) for i in range(n)],
                   "Z": [random.gauss(0,1) for i in range(n)]})

df["XY"] = df["X"] + df["Y"]
grouped = df.groupby(["XY"])
order = grouped.median()["Z"].sort_values().index
sns.boxplot(x="XY", y="Z", data=df, order=order, palette="light:#5A9")
plt.show()

df 看起来像

    X  Y         Z
0   A  a  0.894873
1   C  a -0.568682
2   C  b  0.985260
3   B  c  2.056287
...

情节看起来像

enter image description here