如何明确地将RMSE错误添加到texreg表中

时间:2014-02-15 18:12:43

标签: r s4 texreg

我正在制作一张表来比较使用r和latex的不同线性模型,通过包texreg(这是我第一次使用这个包)。我发现这个包非常有用,但我真的不明白为什么RMSE不包含在extract.lm方法中。

我已经通过这种方式修改了extract.lm方法,将其作为选项包含在内:

extract.lm<-  function (model, include.rsquared = TRUE, include.adjrs = TRUE, include.rmse = TRUE, 
                include.nobs = TRUE, ...) 
      {
        s <- summary(model, ...)
        names <- rownames(s$coef)
        co <- s$coef[, 1]
        se <- s$coef[, 2]
        pval <- s$coef[, 4]
        rs <- s$r.squared
        adj <- s$adj.r.squared
        sig<-s$sigma ##added it
        n <- nobs(model)
        gof <- numeric()
        gof.names <- character()
        gof.decimal <- logical()
        if (include.rsquared == TRUE) {
          gof <- c(gof, rs)
          gof.names <- c(gof.names, "R$^2$")
          gof.decimal <- c(gof.decimal, TRUE)
        }
        if (include.adjrs == TRUE) {
          gof <- c(gof, adj)
          gof.names <- c(gof.names, "Adj. R$^2$")
          gof.decimal <- c(gof.decimal, TRUE)
        }
        if (include.rmse == TRUE) { ##added it
          gof <- c(gof, sig)
          gof.names <- c(gof.names, "RMSE")
          gof.decimal <- c(gof.decimal, TRUE)
        }
        if (include.nobs == TRUE) {
          gof <- c(gof, n)
          gof.names <- c(gof.names, "Num. obs.")
          gof.decimal <- c(gof.decimal, FALSE)
        }
        tr <- createTexreg(coef.names = names, coef = co, se = se, 
                           pvalues = pval, gof.names = gof.names, gof = gof, gof.decimal = gof.decimal)
        return(tr)
      }

然后我在控制台中运行它并搜索以使用

明确覆盖它
setMethod("extract", signature=className("lm","stats"), definition=extract.lm, where="package:texreg")

这也是作者在rforge上建议的方式,但我有这个错误

Error in setMethod ...
  the environment "texreg" is locked; cannot assign methods for function

我也尝试过使用fixInNamespace(),但是如果在终端中插入名称或者使用body()函数可以访问函数的源代码,则不会显示正文函数(这是方法)我访问并修改了它)。

我的错误在哪里?我该怎么做?

注意: 提取物是S4泛型。

请, 我想在包环境中明确地覆盖函数。

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

该错误是由您尝试覆盖程序包环境中的对象引起的。我建议在您的本地环境中创建该方法,当您将texregextract.lm方法结合使用时,R将优先考虑该方法:

setMethod("extract", signature = className("lm", "stats"), 
    definition = extract.lm)

请参阅“统计软件期刊”中文章的第6部分:http://www.jstatsoft.org/v55/i08/