Question

我在MATLAB（版本7）中有一个30000x14000稀疏矩阵，我需要在另一个程序中使用它。调用save不会将其写为ASCII（不支持）。在此怪物上调用full()会导致Out of Memory错误我该如何导出它？

Answer 1

您可以使用find来获取索引＆amp;值向量：

[i,j,val] = find(data)
data_dump = [i,j,val]

您可以使用spconvert从data_dump重新创建数据，这意味着“从稀疏矩阵外部格式导入”（所以我猜这是一个很好的导出格式）：

data = spconvert( data_dump )

您可以使用以下命令保存到ascii：

save -ascii data.txt data_dump

但是这会将索引转储为double，你可以用fopen / fprintf / fclose更好地写出来：

fid = fopen('data.txt','w')
fprintf( fid,'%d %d %f\n', transpose(data_dump) )
fclose(fid)

希望这有帮助。

Answer 2

将稀疏矩阵保存为.mat文件。然后，在另一个程序中，使用合适的库来读取.mat文件。

例如，如果其他程序是用Python编写的，则可以使用scipy.io.mio.loadmat函数，该函数支持稀疏数组并为您提供稀疏的numpy矩阵。

Answer 3

我在MATLAB中使用Java将其保存为文本。 MATLAB代码：


pw=java.io.PrintWriter(java.io.FileWriter('c:\\retail.txt'));
line=num2str(0:size(data,2)-1);
pw.println(line);
for index=1:length(data)
    disp(index);
    line=num2str(full(data(index,:)));
    pw.println(line);
end
pw.flush();
pw.close();

这里data是一个非常大的稀疏矩阵。

Answer 4

您尝试过分区吗？

我的意思是尝试在1000行（或5000）上调用full（），然后重复该过程（如果有效）。

Answer 5

使用find函数获取非零元素的索引......

idcs = find(data);
vals = data(idcs);
...save the index vector and value vector in whatever format you want...

如果需要，可以使用ind2sub将线性索引转换为行，列下标。

如果您需要在下标+值中重新创建matlab中的稀疏矩阵，请使用spconvert。

Answer 6

dlmwrite - 将矩阵写入ASCII分隔文件语法

dlmwrite（filename，M）

dlmwrite（filename，M，'D'）

dlmwrite（filename，M，'D'，R，C）

dlmwrite（filename，M，'attrib1'，value1，'attrib2'，value2，...）

dlmwrite（filename，M，' - append'）

dlmwrite（filename，M，' - append'，属性值列表）

Answer 7

如果这只是一次性交易，那么我只是迭代矩阵并通过暴力将矩阵写入ASCII文件，或者使用@ Veynom's建议并调用full（）行的子集。这可能需要一段时间，但它可能比学习如何读取MATLAB环境之外的.mat文件所需的速度更快。

如果这是您需要定期进行的事情，那么我会采用@ Vebjorn的建议并使用库来读取.mat文件。

Answer 8

使用此脚本： msm_to_mm.m，将MATLAB稀疏矩阵写入MatrixMarket文件。

这个thread也可能有用。

如何将非常大的MATLAB稀疏矩阵保存到文本文件中？

8 个答案: