我有两个大的制表符分隔文件A.tsv和B.tsv,它们看起来像(标题不在文件中):
A.tsv:
ID AGE
User1 18
...
B.tsv:
ID INCOME
User4 49000
...
我想在A中选择ID列表,使得10 =< AGE< = 20并选择B中与列表匹配的行。我想使用GNU并行工具。我的尝试是两步:
cat A.tsv | parallel --pipe -q awk '{ if ($3 >= 10 && $3 <= 20) print $1}' > list.tsv
cat list.tsv | parallel --pipe -q xargs -I% awk 'FNR==NR{a[$1];next}($1 in a)' % B.tsv > result.tsv
第一步有效,但第二步出现错误,如:
awk: cannot open User1 (No such file or directory)
我该如何解决这个问题?即使A.tsv和list.tsv比内存大2到3倍,这种方法也能工作吗?
答案 0 :(得分:3)
$ for I in $(seq 8 2 22); do echo -e "User$I\t$I" >> A.txt; done; cat A.txt
User8 8
User10 10
User12 12
User14 14
User16 16
User18 18
User20 20
User22 22
$ for I in $(seq 8 2 22); do echo -e "User$I\t100${I}00" >> B.txt; done; cat B.txt
User8 100800
User10 1001000
User12 1001200
User14 1001400
User16 1001600
User18 1001800
User20 1002000
User22 1002200
$ cat A.txt | parallel --pipe -q awk '{if ($2 >= 10 && $2 <= 20) print $1}' > list.txt
$ cat B.txt | parallel --pipe -q grep -f list.txt
User10 1001000
User12 1001200
User14 1001400
User16 1001600
User18 1001800
User20 1002000