Question

我有一个名为self的字典.__序列读起来像“ID：DNA sequence”，以下是该字典的一部分

{'1111758': ('TTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAA\n', ''), 
'1111762': ('AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGA\n', ''),
'1111763': ('AGAGTTTGATCCTGGCCTT\n', '') }

我想将字典的值连接成一个单独的字符串或序列（没有\ n而没有“”），也就是说，我想要像

这样的东西

"TTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAAAGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAAGAGTTTGATCCTGGCCTT"

我写下面的代码，然而，它没有给出我想要的东西。我想这是因为该值有两个元素（DNA序列和“”）。我正在努力改进我的代码。谁能帮助我让它发挥作用？

def sequence_statistics(self):
    total_len=self.__sequences.values()[0]
    for i in range(len(self.__sequences)):
        total_len += self.__sequences.values()[i]
    return total_len

Answer 1

这将迭代序列的排序键，提取dict中元组的第一个值并去除空格。请注意{2}中的dicts无序：

''.join(d[k][0].strip() for k in sorted(self.__sequences))

Answer 2

>>> d = {'1111758': ('TTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAA\n', ''),
... '1111762': ('AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGA\n', ''),
... '1111763': ('AGAGTTTGATCCTGGCCTT\n', '') }
>>>
>>> lis = []
>>> for tup in d.values():
...     lis.append(tup[0].rstrip('\n'))
...
>>> ''.join(lis)
  'AGAGTTTGATCCTGGCTCAGATTGAAGAGTTTGATCCTGGCCTTTTAGAGTTTGATCCTGGCTCAGAACGAACGCTGGCGGCAGGCCTAA'
>>>

Answer 3

请尝试使用此代码：

return "".join(v[0].strip() for k, v in self.__sequences.items())

Answer 4

这是一个生成每个值的第一个元素的生成器，其中“\ n”被剥离：

(value[0].strip() for value in self.__sequences.values())

由于您可能希望按键对它们进行排序，因此它会变得稍微复杂一些：

(value[0].strip() for key, value in sorted(self.__sequences.items()))

要把它变成一个由''（空字符串）连接起来的单个字符串，请执行：

''.join(value[0].strip() for key, value in sorted(self.__sequences.items()))

将字典的值连接成单个字符串或序列

4 个答案: