Question

所以我有一个Peptide，它是一串字母，对应于氨基酸说肽是

peptide_sequence = "VEILANDQGNR"

L 位置 4 ， R 位置 11 ，

我想在这些位置之前和之后同时插入"<span class=\"modified_aa\">和</span>。

以下是我的尝试：

我的修改存储在对象修改的数组pep_mods中，其中包含具有位置的属性位置，在本例中为4和11

pep_mods.each do |m|
  peptide_sequence.gsub(peptide_sequence[m.position.to_i-1], "<span class=\"mod\">#{@peptide_sequence[m.location.to_i-1]}</span>" )
end

但是，由于在第一次插入html span标签后有两处修改，字符串中的位置变得完全不同

我怎样才能实现我打算做的事情？我希望很清楚

Answer 1

你应该倒退 - 从最后一个开始进行修改。这样，早期修改的索引就不会改变。

您可能需要以相反的顺序对索引数组进行排序 - 然后您可以使用当前的代码。

Answer 2

Floris的回答是正确的，但如果你想这么做（O(n^2)而不是O(nlgn)），这就是基本的想法。

如果每个字符都有一个与其中一个修改对应的索引，则可以迭代字符检查，而不是依赖gsub。如果索引匹配，请执行修改。否则，请保留原始字符。

modified = peptide_sequence.each_with_index
                           .to_a 
                           .map do |c, i|
                              pep_mods.each do |m|
                                if m.location.to_i = i
                                  %Q{<span class="mod">#{c}</span>}
                                else
                                  c
                                end
                              end
                          end.join('')

Answer 3

好的，以防这对其他人有帮助，这就是我最终做到的方式：

我首先将肽序列转换为数组：

pep_seq_arr = peptide_sequence.split("")

然后使用each_with_index作为Casey提到的

pep_seq_arr.each_with_index do |aa, i|
  pep_mods.each do |m|
    pep_seq_arr[i] = "<span class='mod'>#{aa}</span>" if i == m.location.to_i-1
  end
end

最后加入了数组：

pep_seq_arr.join

比我初想的容易

在同一时间将html插入多个位置的字符串中

3 个答案: