我在R中遇到了以下问题,并希望有人能够快速解决问题。
我有两组数据,A和B,其中A包含控制组的数据,B包含案例组。我为每个组都有相同变量的度量。
在A和B中是子组 - 在某些情况下它们在A和B之间配对 - 假设它们是兄弟姐妹,其中一个或多个可以是一个案例,一个或多个可以是一个控件。
数据看起来像这样:
设置A:
Source Area group pch pch2 col col2 group2
R1-1 1983447 1 0 16 1 1 1
R1-3 1400362 1 0 16 1 1 1
R3-4 2834393 2 1 16 2 2 1
R4-2 2232820 3 2 16 3 3 1
R4-5 1713796 3 2 16 3 3 1
R4-6 1525740 3 2 16 3 3 1
R4-7 1182300 3 2 16 3 3 1
SET B:
Source Area group pch pch2 col col2 group2
R1-2 1246124 1 0 16 1 1 2
R3-1 1627610 2 1 16 2 2 2
R3-2 1401600 2 1 16 2 2 2
R4-1 1367146 3 2 16 3 3 2
R4-3 1764125 3 2 16 3 3 2
R4-4 1299864 3 2 16 3 3 2
来源是ID,区域是感兴趣的变量,组是组,其余是此处不感兴趣的其他变量。
我想要做的是计算集合B中每个个体的相对面积 - 即,相对于集合A中兄弟姐妹的平均面积。我希望这个值在集合B中显示为单独的列(在以下示例中的relArea)。因此输出如下:
输出(设置B):
Source Area group relArea pch pch2 col col2 group2
R1-2 1246124 1 0.736521476 0 16 1 1 2
R3-1 1627610 2 0.574235824 1 16 2 2 2
R3-2 1401600 2 0.494497411 1 16 2 2 2
R4-1 1367146 3 0.821768097 2 16 3 3 2
R4-3 1764125 3 1.06038539 2 16 3 3 2
R4-4 1299864 3 0.781326037 2 16 3 3 2
最后,如果集合B中的个体在集合A中没有兄弟,那么他的relArea值将是相对于所有控制的平均面积的面积(即集合A中的所有度量)。
非常感谢任何帮助。
感谢,
比约
答案 0 :(得分:3)
您可以使用aggregate
计算套装A中每组的平均面积,然后添加新列:
seta = read.table(text="Source Area group pch pch2 col col2 group2
R1-1 1983447 1 0 16 1 1 1
R1-3 1400362 1 0 16 1 1 1
R3-4 2834393 2 1 16 2 2 1
R4-2 2232820 3 2 16 3 3 1
R4-5 1713796 3 2 16 3 3 1
R4-6 1525740 3 2 16 3 3 1
R4-7 1182300 3 2 16 3 3 1 ", header=T)
setb = read.table(text="Source Area group pch pch2 col col2 group2
R1-2 1246124 1 0 16 1 1 2
R3-1 1627610 2 1 16 2 2 2
R3-2 1401600 2 1 16 2 2 2
R4-1 1367146 3 2 16 3 3 2
R4-3 1764125 3 2 16 3 3 2
R4-4 1299864 3 2 16 3 3 2", header=T)
grouped.area = aggregate(seta$Area, by=list(group=seta$group), mean)
setb$relArea = setb$Area / grouped.area$x[match(setb$group, grouped.area$group)]
setb$relArea
# [1] 0.7365215 0.5742358 0.4944974 0.8217681 1.0603854 0.7813260