R中分组数据的计算

时间:2014-02-10 17:36:34

标签: r

我在R中遇到了以下问题,并希望有人能够快速解决问题。

我有两组数据,A和B,其中A包含控制组的数据,B包含案例组。我为每个组都有相同变量的度量。 在A和B中是子组 - 在某些情况下它们在A和B之间配对 - 假设它们是兄弟姐妹,其中一个或多个可以是一个案例,一个或多个可以是一个控件。
数据看起来像这样:

设置A:

Source  Area    group   pch pch2    col col2    group2  
R1-1    1983447     1   0     16    1      1    1   
R1-3    1400362     1   0     16    1      1    1
R3-4    2834393     2   1     16    2      2    1
R4-2    2232820     3   2     16    3      3    1   
R4-5    1713796     3   2     16    3      3    1   
R4-6    1525740     3   2     16    3      3    1   
R4-7    1182300     3   2     16    3      3    1   

SET B:

Source  Area    group   pch pch2    col col2    group2
R1-2    1246124     1   0     16    1      1    2
R3-1    1627610     2   1     16    2      2    2
R3-2    1401600     2   1     16    2      2    2
R4-1    1367146     3   2     16    3      3    2
R4-3    1764125     3   2     16    3      3    2
R4-4    1299864     3   2     16    3      3    2

来源是ID,区域是感兴趣的变量,组是组,其余是此处不感兴趣的其他变量。
我想要做的是计算集合B中每个个体的相对面积 - 即,相对于集合A中兄弟姐妹的平均面积。我希望这个值在集合B中显示为单独的列(在以下示例中的relArea)。因此输出如下:

输出(设置B):

Source  Area    group   relArea pch pch2    col col2    group2
R1-2    1246124   1 0.736521476   0 16        1    1    2
R3-1    1627610   2 0.574235824   1 16        2    2    2
R3-2    1401600   2 0.494497411   1 16        2    2    2
R4-1    1367146   3 0.821768097   2 16        3    3    2
R4-3    1764125   3 1.06038539    2 16        3    3    2
R4-4    1299864   3 0.781326037   2 16        3    3    2

最后,如果集合B中的个体在集合A中没有兄弟,那么他的relArea值将是相对于所有控制的平均面积的面积(即集合A中的所有度量)。

非常感谢任何帮助。

感谢,
比约

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

您可以使用aggregate计算套装A中每组的平均面积,然后添加新列:

seta = read.table(text="Source  Area    group   pch pch2    col col2    group2  
  R1-1    1983447     1   0     16    1      1    1   
  R1-3    1400362     1   0     16    1      1    1
  R3-4    2834393     2   1     16    2      2    1
  R4-2    2232820     3   2     16    3      3    1   
  R4-5    1713796     3   2     16    3      3    1   
  R4-6    1525740     3   2     16    3      3    1   
  R4-7    1182300     3   2     16    3      3    1  ", header=T)
setb = read.table(text="Source  Area    group   pch pch2    col col2    group2
  R1-2    1246124     1   0     16    1      1    2
  R3-1    1627610     2   1     16    2      2    2
  R3-2    1401600     2   1     16    2      2    2
  R4-1    1367146     3   2     16    3      3    2
  R4-3    1764125     3   2     16    3      3    2
  R4-4    1299864     3   2     16    3      3    2", header=T)
grouped.area = aggregate(seta$Area, by=list(group=seta$group), mean)
setb$relArea = setb$Area / grouped.area$x[match(setb$group, grouped.area$group)]
setb$relArea
# [1] 0.7365215 0.5742358 0.4944974 0.8217681 1.0603854 0.7813260