GraphML图形的可视化？

Question

在Mac OSX或Linux上可视化GraphML中定义的图形的最佳选项是什么？根据{{​​3}}，R + iGraph似乎是一个有效的解决方案，但我想知道是否有更简单的解决方案，理想情况下是一个简单的“graphml2png”命令行应用程序。有什么想法吗？

Answer 1

我使用yEd，它适用于Linux，Windows和OSX。 此外，它还可以导出为PDF，PNG，SVG，BMP等多种格式

不幸的是，没有命令行支持AFAIK

Answer 2

我没有完整的食谱，但我可以分享我的想法。

由于图表可以通过多种方式可视化，因此您应该能够以某种方式管理其外观。简单地绘制节点和边缘而不进行任何预处理并不是一个好的选择 - 这种方法会给你一堆随机的边和节点，特别是在大图上。

这是一个示例算法，用于获得图表的干净且具有视觉吸引力的表示：

1. 在图表上运行一些强制导向算法。
2. 通过模块化类计算图形模块性并为每个节点着色。
3. 根据程度改变每个节点的大小。
4. 如果图形太大，请过滤掉您不感兴趣的节点（可能是程度较低的节点）。
5. 根据重量更改边缘厚度。
6. 向节点和边缘添加标签。

您可以使用Gephi（在手动模式下）执行此类操作。他们还提供Gephi Toolkit应该能够自动化这些东西（不幸的是，我自己还没有尝试过）。所以我尝试编写使用此工具包的简单控制台Java程序。

以下是使用上述算法可视化的图表示例：