Pandas:计算数据框中的唯一值

时间:2014-02-07 16:59:20

标签: python pandas

我们有一个如下所示的DataFrame:

> df.ix[:2,:10]
    0   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10
0   NaN NaN NaN NaN  6   5  NaN NaN  4  NaN  5
1   NaN NaN NaN NaN  8  NaN NaN  7  NaN NaN  5
2   NaN NaN NaN NaN NaN  1  NaN NaN NaN NaN NaN

我们只想要DataFrame中所有唯一值的计数。一个简单的解决方案是:

df.stack().value_counts() 

然而: 1.看起来stack返回副本,而不是视图,在这种情况下,内存禁止。它是否正确? 2.我想按行对DataFrame进行分组,然后为每个分组获取不同的直方图。如果我们忽略stack的内存问题并暂时使用它,那么如何正确地进行分组呢?

d = pd.DataFrame([[nan, 1, nan, 2, 3],
              [nan, 1, 1, 1, 3],
              [nan, 1, nan, 2, 3],
              [nan,2,2,2, 3]])

len(d.stack()) #14
d.stack().groupby(arange(4))
AssertionError: Grouper and axis must be same length

堆叠的DataFrame有一个MultiIndex,其长度小于n_rows*n_columns,因为nan已被移除。

0  1    1
   3    2
   4    3
1  0    1
   1    1
   2    1
   3    1
   4    3
    ....

这意味着我们不容易知道如何构建我们的分组。仅仅在第一级操作会好得多,但后来我不知道如何应用我真正想要的分组。

d.stack().groupby(level=0).groupby(list('aabb'))
KeyError: 'a'

编辑:一种不使用堆叠的解决方案:

f = lambda x: pd.value_counts(x.values.ravel())
d.groupby(list('aabb')).apply(f)
a  1    4
   3    2
   2    1
b  2    4
   3    2
   1    1
dtype: int64
但是,看起来很笨重。如果有更好的选择,我很高兴听到它。

编辑:丹的评论显示我有一个错字,虽然纠正仍然没有让我们到达终点。

2 个答案:

答案 0 :(得分:7)

我认为您正在执行行/列操作,因此可以使用apply

In [11]: d.apply(pd.Series.value_counts, axis=1).fillna(0)
Out[11]: 
   1  2  3
0  1  1  1
1  4  0  1
2  1  1  1
3  0  4  1

注意:0.14中有一个value_counts DataFrame方法,可以提高效率和简洁性。

值得注意的是,pandas value_counts函数也适用于numpy数组,因此您可以使用{{传递数据框的值作为一维数组视图 3}}):

In [21]: pd.value_counts(d.values.ravel())
Out[21]: 
2    6
1    6
3    4
dtype: int64

此外,你非常接近这一点,但你需要堆叠和取消堆栈:

In [22]: d.stack().groupby(level=0).apply(pd.Series.value_counts).unstack().fillna(0)
Out[22]: 
   1  2  3
0  1  1  1
1  4  0  1
2  1  1  1
3  0  4  1

这个错误似乎有点自我解释(4!= 16):

len(d.stack()) #16
d.stack().groupby(arange(4))
AssertionError: Grouper and axis must be same length

也许你想通过:

In [23]: np.repeat(np.arange(4), 4)
Out[23]: array([0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 2, 2, 2, 2, 3, 3, 3, 3])

答案 1 :(得分:1)

没有足够的代表发表评论,但Andy回答:

pd.value_counts(d.values.ravel()) 

是我个人使用的,在我看来是迄今为止最通用和易读的解决方案。另一个优点是易于使用列的子集:

pd.value_counts(d[[1,3,4,6,7]].values.ravel()) 

pd.value_counts(d[["col_title1","col_title2"]].values.ravel()) 

这种方法有什么不利,或者你想使用stack和groupby的任何特殊原因?