Question

我正在尝试拆分txt文件的内容以使用perl提取相关信息，但我似乎无法正确格式化我的split语句。该文件的一行如下所示：

1.8|8|28|98|1pter-p22.1|SAI1, MTS1, TFS1|C|Suppression of anchorage independence-1 (malignant transformation suppression-1)|154280|S, H|||4(Tfs1)|

我的split语句如下所示：

my $file;
my $important;
my $line;
my @info;
foreach $line (@OMIMFile) {
my ($noSystem, $month, $day, $year, $cytoLoc, $geneSymb
    , $geneStat, $title, $mimNo, $method, $comment, $disorder
    , $mousCorr, $ref) = split ("|", $line);
    $important = $geneSymb.":".$disorder;
    push @info, $important if ($geneStat =~ /C/i);
}

我希望@info的每一行都是由冒号分隔的$ geneSymb和$ disor的组合，但是目前@info的打印不返回任何内容，而且$ important返回这样的输出：

|:||:|2:7|:|1:||:|0:||:|0:|1:85:|7:|9:01:37:93:93:93:92:71: .....

我在哪里错了？

提前致谢！

Answer 1

这是一个修复。

你的一些变量不是本地的。

my $file;
my @info;
foreach my $line (@OMIMFile) {
my ($noSystem, $month, $day, $year, $cytoLoc, $geneSymb
    , $geneStat, $title, $mimNo, $method, $comment, $disorder
    , $mousCorr, $ref) = split (/\|/, $line);
    my $important = $geneSymb.":".$disorder;
    push @info, $important if ($geneStat =~ /C/i);
}

Answer 2

使用哈希切片会更加整洁：

my @fields = qw/ noSystem month day year cytoLoc geneSymb geneStat title mimNo method comment disorder mousCorr ref /;
my @info;

for (@OMIMFile) {
  my %line;
  @line{@fields} = split /\|/;
  my $important = join ':', @line{ qw/ geneSymb disorder / };
  push @info, $important if $line{geneStat} =~ /C/i
}

Perl：大文本文件的分割循环

2 个答案: