在geom_boxplot上覆盖geom_points（）（fill = group）？

Question

此处是我的代码：

require(ggplot2)
value <- rnorm(40, mean = 10, sd = 1)
variable <- c(rep('A', 20), rep('B', 20))
group <- rep(c('Control', 'Disease'), 20)
data <- data.frame(value, variable, group)

ggplot(data, aes(x=variable, y=value)) +
  geom_boxplot(aes(fill=group)) +
  geom_point(aes())

这将箱形图按照我想要的方式分组。但是，所有组的分数都是重叠的，我希望将它分成几组。我该怎么做呢？

Answer 1

使用position_dodge()获取积分，并在group=group的{​​{1}}内添加aes()。

geom_point()

Answer 2

我不知道这是什么时候推出的，但是有一个名为position_jitterdodge的新功能，可以简化这一点，无论你是否想要抖动。 用法：

ggplot(data, aes(x=variable, y=value, fill=group)) +
  geom_boxplot() +
  geom_point(position=position_jitterdodge())
  # or, if you dont need jittering
  # geom_point(position=position_jitterdodge(jitter.width = 0, jitter.height = 0)) 

http://ggplot2.tidyverse.org/reference/position_jitterdodge.html

Answer 3

您也可以尝试ggbeeswarm。 在这里，我比较了geom_beeswarm和geom_quasirandom的输出：

library(ggbeeswarm)
library(ggplot2)

ggplot(data, aes(x=variable, y=value, fill=group)) +
  geom_boxplot() +
  geom_beeswarm(dodge.width=0.75) +
  geom_quasirandom(dodge.width=.75, col=2) 

Answer 4

这是尝试将Didzis的建议应用于数据集，其中并非所有组都有异常值，因此这些点不与正确的方框对齐。

数据文件： https://cmu.box.com/shared/static/2hxp2oms5et1ktr9hukdr539b6svq1cg.rds

require(data.table)
require(ggplot2)

d <- readRDS("2hxp2oms5et1ktr9hukdr539b6svq1cg.rds")

ggplot(d) + 
  geom_boxplot(aes(x=factor(game),y=N,fill=.group),outlier.shape=NA) + 
  geom_point(data=dd.sum1[,.SD[which(N %in% boxplot.stats(N)$out)],by=game][,.group:=factor(.group,levels=.groups)][,],aes(x=factor(game),y=N,color=.group,group=.group),
             position=position_dodge(width=0.75),
             size=.5) +
  facet_grid (type~., scales="free_x", space="free_x") +
  xlab("Game number") +
  ylab("Count") +
  scale_color_brewer("Group",palette="Set1",drop=FALSE) +
  scale_fill_brewer("Group",palette="Set1",drop=FALSE) +
  theme(axis.text.x=element_text(size=7),legend.position="top")