Question

我的想法

我正在尝试为R创建一个库，但我无法加载它。

我得到的错误是

Error in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...) : 
  unable to load shared object '/home/stenver/R/x86_64-pc-linux-gnu-    library/2.15/RcppWilcoxonTest/libs/RcppWilcoxonTest.so':
  /home/stenver/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.15/RcppWilcoxonTest/libs/RcppWilcoxonTest.so:     undefined symbol: gsl_cdf_gaussian_Q
Error: loading failed

我的Makevars文件如下所示：

PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()" `

我试过改变那里的各种东西。

我的NAMESPACE文件如下所示：

useDynLib(RcppWilcoxonTest)
useDynLib(gsl)
useDynLib(WilcoxonTest)

import(Rcpp)

export(RcppWilcoxonTest)

失败发生在我尝试使用的动态共享库中。我已将动态库文件复制到src文件夹，因此R会自行编译它们，但它没用。理想情况下，我想将库和Rcpp接口实现保存在单独的文件夹中。

在某些时候，我也尝试使用RcppGSL，但它没有帮助，因为R在安装后无法找到包。

可以在这里看到整个存储库：

https://bitbucket.org/stenver/wilxoni-astaku-test/src/8c9b5da2cd9a97fd6c1a569e468c50ca95e2e06f?at=default

在RcppWilcoxonTest文件夹中

Answer 1

您需要src/Makevars文件中的以下内容;那是（借用RcppGSL做事的方式）：

PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` `gsl-config --libs`

所以R知道在编译包时需要链接GSL。有关详细信息，请参阅R-exts。

通过检查RcppGSL如何配置以查找GSL，并在包中使用类似的方法，您可以学到很多东西。

Answer 2

凯文的回答可能会对你有所帮助，但实际上有一个CRAN包明确依赖于RcppGSL，其中我做了

edd@max:~/git/rcppziggurat/src$ cat Makevars
PKG_CPPFLAGS = -I. -I../inst/include
## Use the R_HOME indirection to support installations of multiple R version
PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` \
           `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "RcppGSL:::LdFlags()"`
edd@max:~/git/rcppziggurat/src$

我在这里为显示包裹了一行。

实质上，RcppGSL会调用Kevin提到的gsl-config。

Rcpp找不到gsl库

2 个答案: