Question

大家好我有一堆荧光标记颗粒的图像正在经过时间。图像堆栈是灰度缩放的。

我通过获取第三维中图像堆栈的最大值来计算最大强度投影。

Example:
ImageStack(x,y,N) where N = 31 image frames.

2DProjection = max(ImageStack,[],3)

现在，由于2D投影图像是黑白的，我希望指定一个颜色渐变，这样我就可以了解粒子随时间的流动。有没有办法可以用彩色覆盖这个图像，这样我才能知道粒子的起始位置以及它最终的位置？

谢谢！

Answer 1

您可以使用max的第二个输出来获取特定最大值来自哪个帧。 max返回一个索引矩阵，指示每个最大值的索引，在您的情况下，它将是它发生的特定帧。如果将此与imagesc函数一起使用，则可以绘制粒子随时间移动的方式。例如：

ImageStack(x,y,N) where N = 31 image frames.

[2DProjection,FrameInfo] = max(ImageStack,[],3);
imagesc(FrameInfo);
set(gca,'ydir','normal'); % Otherwise the y-axis would be flipped

Answer 2

每个图像着色后，您可以将每个图像的亮像素相加。这样，您将在重叠区域上使用混合颜色，您将错过使用最大功能。虽然我比以前更喜欢上一个答案。

hStep = 1/N;
currentH = 0;
resultImage = uint8(zeros(x,y,3));
for i = 1 : N
   rgbColor = hsv2rgb(currentH,1,0.5);
   resultImage(:,:,1) = resultImage(:,:,1) + im(:,:,i) * rgbColor(1);
   resultImage(:,:,2) = resultImage(:,:,2) + im(:,:,i) * rgbColor(2);
   resultImage(:,:,3) = resultImage(:,:,3) + im(:,:,i) * rgbColor(3);
   currentH = currentH + hStep;
end

最大强度投影matlab与颜色

2 个答案: