使用（x，y）协调顺序创建热图

Question

我使用R

绘制热图

library("ggplots")
heatmap.2(correlation,col=topo.colors(75), scale="none",
      key=TRUE, symkey=FALSE, density.info="none", trace="none", cexRow=0.5)

但是，热图不是根据数据顺序（相关）分配的。 如果仔细观察x和y标签，它就完全混淆了。 那么，我如何通过输入数据有序（x，y）格式绘制热图？

Answer 1

我想你想在你的函数中添加Rowv = FALSE和Colv = FALSE参数。

默认设置是按行和列对数据进行聚类，将Rowv和Colv设置为FALSE（或NA）将阻止此操作：

library("gplots")
heatmap.2(correlation,col=topo.colors(75), scale="none",
      key=TRUE, symkey=FALSE, density.info="none", trace="none", cexRow=0.5, Colv=FALSE, Rowv=FALSE)