总结dplyr中的值 - 崩溃RStudio

时间:2014-01-25 07:34:10

标签: r rstudio dplyr

可以dplyrsummarise执行链接data.frame操作吗?

我的data.frame具有以下结构:

data_df = tbl_df(data)    
data_df %.%
        group_by(col_1) %.%
        summarise(number_of= length(col_2)) %.%
        summarise(sum_of = sum(col_3)) 

这会导致RStudio遇到fatal error - R Session Aborted消息

通常使用plyr我会毫无问题地包含这些summarise函数。

更新

数据为here.

代码是:

library(dplyr)

orth <- read.csv('orth0106.csv')
orth_df = tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure)) %.%
    summarise(SSIs = sum(SSI))

1 个答案:

答案 0 :(得分:10)

我可以在运行RStudio 0.97.551的Windows 7机器上重现错误

这可能是因为你正在调用summarise并将其链接到那些不存在的东西上。您可以summarise使用2个不同的列,就像我在这里所做的那样。

url <- "https://raw.github.com/johnmarquess/some.data/master/orth0106.csv"

library(dplyr)

orth <- read.csv(url)
orth_df <- tbl_df(orth)


orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure), SSIs = sum(SSI))

## Source: local data frame [18 x 3]
## 
##    Hospital Procs SSIs
## 1         A   865   80
## 2         B  1069   38
## 3         C   796   24
## 4         D   891   35
## 5         E   997   39
## 6         F   550   30
## 7         G  2598  128
## 8         H   373   27
## 9         I  1079   70
## 10        J   714   30
## 11        K   477   30
## 12        L   227    2
## 13        M   125    6
## 14        N   589   38
## 15        O   292    3
## 16        P   149    9
## 17        Q  1984   52
## 18        R   351   13

无论如何,这似乎是一个RStudio或dplyr错误。我会向哈德利提出一个问题,因为他可能会关心这两种方式。 https://github.com/hadley/dplyr/issues

编辑这(你的第一次通话)也会导致rgui(windows)和终端崩溃:

R version 3.0.2 (2013-09-25)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)

这表示Hadley和Romain想要了解dplyr问题。

为了得到我的第一点,我们运行:

orth_df %.%
    group_by(Hospital) %.%
    summarise(Procs = length(Procedure))

Source: local data frame [18 x 2]

   Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
4         D   891
5         E   997
6         F   550
7         G  2598
8         H   373
9         I  1079
10        J   714
11        K   477
12        L   227
13        M   125
14        N   589
15        O   292
16        P   149
17        Q  1984
18        R   351

%.% summarise(SSIs = sum(SSI))应该在哪里找到SSI

所以你认为发生的链接失败了。据我所知%.%ggplot2的工作方式不完全相似,但相似。在ggplot2中,在初始映射中传递数据后,您可以稍后访问它。这里%。%似乎修改抓住左边的块并按照这样操作:

enter image description here

所以你抓住了:

   Hospital Procs
1         A   865
2         B  1069
3         C   796
.
.
.
17        Q  1984
18        R   351

当您使用%.% summarise(SSIs = sum(SSI))并且没有SSI时。因此,我想到的类比是serial vs. parallel wiring Christmas lights%.% = serial ggplot() + = parallel。这是一个非程序员对事物的理解,而R大师可能会告诉我,我是愚蠢的,但是现在这是你得到的最好的理论。