从熔化的数据框中引用x轴变量,以使用R中的ggplot2进行绘图

时间:2014-01-24 11:11:56

标签: r ggplot2 reshape2 melt

我有一个数据框df,其中有10列,例如

row.names   c(300, 400, 500, 600, 700)  X1  X2  X3  X4  X5  X6  X7  X8  X9
1   absTLM_3_4  300 -4.147782e-08   -3.360635e-08   -3.306786e-08   -3.133482e-08   -3.124207e-08   -3.056317e-08   -3.020253e-08   -2.950814e-08   -2.955155e-08
2   absTLM_4_5  400 -3.703708e-08   -3.013687e-08   -2.746570e-08   -2.627163e-08   -2.528328e-08   -2.457543e-08   -2.437666e-08   -2.412295e-08   -2.358447e-08
3   absTLM_5_6  500 -3.575756e-08   -2.694028e-08   -2.457341e-08   -2.331162e-08   -2.262283e-08   -2.180886e-08   -2.104917e-08   -2.101946e-08   -2.081650e-08
4   absTLM_6_7  600 -2.454283e-08   -2.152165e-08   -1.967477e-08   -1.885213e-08   -1.835989e-08   -1.814608e-08   -1.806438e-08   -1.785795e-08   -1.784158e-08
5   absTLM_7_8  700 -2.317125e-10   -1.029456e-08   -1.076342e-08   -1.365264e-08   -1.378578e-08   -1.457421e-08   -1.463740e-08   -1.480280e-08   -1.515121e-0

现在我想在x轴上绘制第1列,而在y轴上绘制第2,5,6列和第8列。为此,我使用以下代码,

x4 <- melt(df, id=names(df)[1], measure=names(df)[c(2, 5, 6, 8)], variable = "cols")
plt <- ggplot(x4) +
        geom_line(aes(x=x,y= value, color=cols), size=1) +
        labs(x = "x", y = "y")

当我调用绘图对象plt时,我在eval(expr,envir,enclos)中出现错误:找不到对象'x'
有人可以指出我应该在这里更改以正确显示情节。

感谢。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

看起来您的列名称有误。试试这个:

x4 <- melt(df, id=names(df)[1], measure=names(df)[c(2, 5, 6, 8)], variable = "cols")
colnames(x4)[1] <- "x"
plt <- ggplot(x4) +
        geom_line(aes(x=x,y= value, color=cols), size=1) +
        labs(x = "x", y = "y")

答案 1 :(得分:0)

以下代码未正确绘制数据的原因是由于列标题名称c(300, 400, 500, 600, 700)是数据框df中第一列的名称。

x4 <- melt(df, id=names(df)[1], measure=names(df)[c(2, 5, 6, 8)], variable = "cols")
plt <- ggplot(x4) +
        geom_line(aes(x=x,y= value, color=cols), size=1) +
        labs(x = "x", y = "y")

因此,必须首先更改df的列标题名称,根据Brandon Bertelsen的建议,c(300, 400, 500, 600, 700)的列标题名称已由以下行更改为x代码,

colnames(df)[1] <- "x"

更改列标题名称后,可以熔化数据框,之后绘图工作正常,

x4 <- melt(df, id=names(df)[1], measure=names(df)[c(2, 5, 6, 8)], variable = "cols")
plt <- ggplot(x4) +
        geom_point(aes(x=x,y= value, color=cols), size=2) +
        labs(x = "x", y = "y")

因此情节plt看起来像这样,

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