找到散点图的正确标记大小

Question

我想绘制一个网格，网格中的每个节点都用一个点绘制，带有一定的颜色代码（取自存储在节点中的矢量）。

这里的网格大小取决于我正在运行的模拟的大小。我还没有弄清楚画布大小和标记大小之间的关系。现在我使用以下公式：

markersize = (figsize*figsize*dpi*dpi)/(xdim*ydim)
plt.scatter(X, Y, s=markersize/3, marker='s', c=Z, cmap=cm.rainbow)
plt.show()

这是我对sigize和dpi（分别使用15和80）进行平方，并除以网格的维数。最后，我把它除以3，因为我发现它可以工作。

但我无法弄清楚如何分析得到正确的标记大小。我想要的是一个网格，其中每个方块使用尽可能多的空间但在其他节点的空间上没有“infringinig”，因此标记重叠。

据我所知，figsize以英寸为单位。 dpi是 - 每英寸点数，标记大小以 - 点指定。如果这些点与点相同，那么您将在每个轴上具有dpi figsize点数量。 xdim ydim是网格中的节点数量。然后划分pow（dpi figsize，2）/ xdim ydim应该给出每个节点的点数量，以及我认为的每个标记的正确大小。但这使得标记太大了。我分开了3次，它实际上适用于我经常跑的尺寸，但不是全部。 （我猜一个点和点不一样，但是关系是什么？）

我如何找到正确答案？理想情况下，我想要一个非常精细的图片，我可以放大某些区域，以更好地了解颜色的细微差别。

Answer 1

如果您想精确控制标记大小并使其与图形一致，则可以使用patch而不是常规标记。这是一个例子：

from matplotlib import pyplot as plt
from matplotlib.patches import Circle

x = [1, 2, 3, 4, 5]
y = [1, 3, 1, 2, 4]
colors = [10, 215, 30, 100]

cmap = plt.cm.jet
fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, aspect='equal')

for (x, y, c) in zip(x, y, colors):
    ax.add_artist(Circle(xy=(x, y), radius=0.5, color=cmap(c)))      

ax.set_xlim(0, 6)
ax.set_ylim(0, 6)
plt.show()

您也可以使用矩形而不是圆圈。