Question

调试加载到R中的共享对象的最有效和最快捷的方法是什么，特别是在OS X Mavericks上？我主要对调试编译的Rcpp代码感兴趣。

我已经阅读了有关使用gdb的调试编译代码（http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-exts.html#Debugging-compiled-code）的R外部代码，但是Mavericks并未正式支持gdb。但是，似乎lldb是一个可行的替代方案吗？我找到了最有用的资源，用于研究如何从Dirk对这篇文章的回复中调试R中的编译代码（感谢Dirk！）（Debugging (line by line) of Rcpp-generated DLL under Windows）。

我可以按照下面逐步明确说明的步骤成功调试已编译的Rcpp代码，其他Rcpp新手可能会觉得这很有用（为长度道歉，但我认为最好是明确而不是省略并且是模糊）。但是这个开发过程有点乏味且耗时。

问题：

与我在下面的操作相比，是否有更快速和/或更简单的方法来调试已编译的Rcpp代码？
我是Rstudio的忠实粉丝，并希望合并从该IDE创建的调试共享对象，所以如果有人知道如何做到这一点，我会有兴趣知道吗？ Rstudio似乎使用属性，看起来下面的步骤4需要修改，因为编译后在临时目录中似乎没有.cpp文件（在我的示例中，没有“file5156292c0b48.cpp”文件）

步骤：

1）（一次关闭）转到目录〜/ .R（带有。的隐藏目录）。创建一个名为“Makevars”的新文件，并在其中添加行CXXFLAGS=-g -O0 -Wall。

2）在终端中，键入R -d lldb以启动R. lldb现在将启动。

3）在lldb命令行输入run。这将启动R.

4）编译Rcpp代码并找到编译对象的位置。德克对上述帖子的回应显示了一种方法。这是我将在这里使用的一个例子。在R中运行以下命令：

library(inline)

fun <- cxxfunction(signature(), plugin="Rcpp", verbose=TRUE, body='
int theAnswer = 1;
int theAnswer2 = 2;
int theAnswer3 = 3;
double theAnswer4 = 4.5;
return wrap(theAnswer4);
')

这会创建一个编译的共享对象和其他文件，可以通过在R中运行setwd（tempdir（））和list.files（）找到。会有一个.cpp文件，比如“file5156292c0b48.cpp”和.so文件如“file5156292c0b48.so”

5）通过在R命令行运行dyn.load("file5156292c0b48.so")将共享对象加载到R中

6）现在我们要在这个.so对象中调试C ++代码。点击ctrl + c返回lldb。现在我想在file5156292c0b48.cpp文件中的特定行设置一个断点。我通过打开另一个终端并查看file5156292c0b48.cpp中感兴趣的行号来找到正确的行号。假设它是第31行，它对应于theAnswer = 1中的行;以上在我的例子中。然后我在lldb命令行输入：breakpoint set -f file5156292c0b48.cpp -l 31。调试器打印出已经设置了断点和其他一些东西...

7）通过在lldb中运行cont返回R（在我按下Enter键之前，R提示不会自动出现）并调用该函数。在R命令行运行fun()。现在我正在调试共享对象（点击n转到下一行，p [对象名]打印变量等）....

Answer 1

要调试这样的简单Rcpp脚本，你可以做的一件事就是创建一个嵌入了R的.cpp应用程序（带有一个main）。这样你可以直接使用Xcode调试它，这将为你提供一个很好的调试经验。

当您开始想要调试包时，它会变得更加复杂。

Answer 2

这很难。我尝试使用独立的C ++应用程序来运行Xcode和Eclipse，但是很难让所有的头文件和库工作。此外，RcppExport代码通过一个似乎真正混淆Xcode的指针调用你的真实R函数，我无法进入我的函数。

我最终得到了（gdb或lldb）：在R： R -d lldb 在调试器中，设置断点： b functionName run 在R： .Call(etc) # or just call your R code which invokes compiled C/C++ code 然后在调试器中一旦发生中断，你就可以步进，检查帧等等。

这个lldb / gdb command quick reference帮了很多忙。

忘记在此时尝试在GUI中执行此操作。希望Rstudio能够实现这一目标。

什么是有效的方法来调试R中加载的Rcpp编译代码（在OS X Mavericks上）？

2 个答案: