单击下多个HSP的含义是什么？

Question

我是生物信息学领域的新手。我正在看一个BLAST xml输出文件，我试图理解为什么每次爆炸都会有多个HSP。我知道HSP代表高分段对，但我并不真正理解多个HSP如何以及为什么被分配给单个命中。

Answer 1

Okk，所以我给你一个大致的想法。例如，对于序列A和序列B，序列的多个部分可以是相同/相似或高分。更具体一点：

序列A：####### AAAAAA ATCG /////////////////////////// ////

序列B：####### CCCCCC ???????? ATCG /////////////////////////// ////

因此，您将获得上述两个序列的三个结果。一个用于'＃'部分，另一个用于'？'部分，最后一部分为'/'部分。无论如何，我很高兴有更多的人质疑生物信息学相关的东西。

干杯！