如何在Mayavi的网格图中使用蒙版?

时间:2014-01-16 23:50:35

标签: python 3d plot enthought mayavi

我正在使用python和mayavi2进行3D绘图。我正在使用网格命令绘制球体,现在我想为球体的一些面板着色不同的颜色。看起来这就是面具选项的用途,但我不能让它起作用(我只是让整个球体重新着色)。

http://docs.enthought.com/mayavi/mayavi/auto/mlab_helper_functions.html#mayavi.mlab.mesh “mask:boolean mask array to suppress some data points”

我用:

mesh(X,Y,Z, color = (1,1,1), opacity=0.5)

将整个球体着色为白色,然后

mesh(X,Y,Z, color = (1,0,1), mask = active_region, opacity=0.5) 

将某些部分涂成紫色,其中

active_region = [[False False False False False False  True]
                 [False False False False False False  True]
                 [False False False False False  True  True]
                 [False False False  True  True  True  True]
                 [False False  True  True  True  True  True]
                 [False False False  True  True  True  True]
                 [False False False False False False  True]]

但这导致完全紫色的球体。 X,Y和Z都是具有形状(7,7)的数组,就像active_region一样。我做错了什么?

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

遮罩基于标量,而不是在设置纯色时。试试这个:

import numpy as np
m = mesh(X,Y,Z, mask=active_region, opacity=0.5)
m.mlab_source = ones_like(X)

通过将标量设置为屏蔽的Nan来进行屏蔽。绘制的几何图形相同,但如果标量为Nan,则不显示蒙版区域。

无论如何,这里有一个完整的工作示例供您参考:

import numpy as np
phi, theta = np.mgrid[0:np.pi:100j, 0:2 * np.pi:100j]
x = np.sin(phi) * np.cos(theta)
y = np.sin(phi) * np.sin(theta)
z = np.cos(phi)
mask = np.zeros_like(x).astype(bool)
mask[::5] = True
mask[:,::5] = True

from mayavi import mlab
mlab.mesh(x, y, z, scalars=z, mask=mask)

请注意,您不需要提供标量,只是如果您提供明确的颜色,则不会有屏蔽。此处的标量也只是设置为z,您可以使用任何兼容的数组,即使是ones_like(X)的常量值。

事实证明,如果你有一个恒定的标量VTK 5.6似乎没有正确掩盖你的分数,如果你有VTK 5.10你可以做到以下几点:

m = mlab.mesh(x, y, z, scalars=scalars, mask=mask)
m.module_manager.scalar_lut_manager.lut.nan_color = 0, 0, 0, 0

否则,使用scalar=z并设置一个恒定的颜色查找表。您可以通过单击管道编辑器上的“颜色和图例”来创建自己的,然后单击“启动lut编辑器”。要使用此自定义颜色映射,请执行以下操作:

scalars = np.ones_like(x)
m = mlab.mesh(x, y, z, scalars=scalars, mask=mask)
m.module_manager.scalar_lut_manager.lut_mode = 'file'
m.module_manager.scalar_lut_manager.file_name = '/path/to/your.lut'

如果你不想搞乱LUT编辑器和所有malarky,这里有一个纯粹的numpy版本,你可以直接从Python。

m = mlab.mesh(x, y, z, scalars=z, mask=mask)
# Lets make some colors:
#    this is an array of (R, G, B, A) values (each in range 0-255), there should
#    be at least 2 colors in the array.
colors = np.zeros((2, 4), dtype='uint8')
# Set the green value to constant.
colors[:,1] = 255
# the alpha value to fully opaque.
colors[:,3] = 255
# Now use this colormap.
m.module_manager.scalar_lut_manager.lut.table = colors

请注意,colors数组应至少包含2种颜色,并且可以包含任意数量的颜色。对于恒定的颜色2应该足够了。

HTH。