在R运行clogit中'抓住了segfault'和'内存未映射'

Question

我正在尝试使用R中的以下脚本对9乘484995115矩阵运行条件逻辑回归

library(splines)
library(survival)
All <- read.table(pipe("cut -d';' -f1,2,4-9 /scratch/rvonscha/all.txt"), header=TRUE, 
sep=";", na.strings="NA", dec=",", strip.white=TRUE)
model <- clogit(Alliance ~ OVB + BVB + CVC + EarlyStage + AvgVCSize + NumberVC +   
strata(Strata), data=All)
summary(model)  

但是在具有256GB内存的节点上计算2小时后，程序将停止并显示以下错误消息：

*** caught segfault ***
address 0x7f687db38700, cause 'memory not mapped'

Traceback:
1: model.matrix.default(Terms2, m)
2: model.matrix(Terms2, m)
3: coxph(formula = Surv(rep(1, 484995115L), Alliance) ~ OVB + BVB +     CVC +      
EarlyStage + AvgVCSize + NumberVC + strata(Strata),     method = "exact")
4: eval(expr, envir, enclos)
5: eval(coxcall, sys.frame(sys.parent()))
6: clogit(Alliance ~ OVB + BVB + CVC + EarlyStage + AvgVCSize +     NumberVC + 
strata(Strata))
aborting ... 

出现此错误的原因是什么？在计算时间内从未超过存储容量。 我可以在代码中更改哪些内容以避免此错误？

我真的很感激有任何帮助来解决这个问题。

非常感谢你。