我在R中使用nlme包运行混合效应模型。我的数据包括82只动物(重复),这82只动物按3个品种(定义为分类变量)分组,我的连续变量是时间平方,回应是我的。 混合模型的形式是:
model<-lme(MY~time + breed*time + time-squared,random=1|Animal, data=mydata)
结果如下:
Linear mixed-effects model fit by REML
Data: na.omit(centred_phuong)
AIC BIC logLik
93698.27 93769.46 -46840.13
Random effects:
Formula: ~1 | Cow_code
(Intercept) Residual
StdDev: 1.283306 2.453689
Fixed effects: MY ~ time + time * Breed + time_squared
Value Std.Error DF t-value p-value
(Intercept) 1.3398578 0.2495665 20048 5.36874 0.0000
DFC 0.0523516 0.0003675 20048 142.43468 0.0000
Breed2 0.4998856 0.3521235 78 1.41963 0.1597
Breed3 -0.3683371 0.3520760 78 -1.04619 0.2987
Time_squared 0.0001213 0.0000025 20048 48.14845 0.0000
Time:Breed2 0.0084160 0.0005011 20048 16.79463 0.0000
Time:Breed3 -0.0086297 0.0005028 20048 -17.16272 0.0000
正如我从这些结果中所理解的,该模型将品种2和3的截距和斜率与品种1的截距和斜率进行比较,并且品种2和品种2之间没有比较?无论如何要指明这个吗?
我希望能得到你的建议!感谢