Question

当我发现python regex模块允许模糊匹配时，我越来越高兴，因为它似乎是解决我的许多问题的简单方法。但是现在我遇到了一个问题，我没有从文档中找到任何答案。

如何使用新的模糊度值功能将字符串编译为regexp？

说明我的日常需求并提供一小段代码

import regex
f = open('liner.fa', 'r')
nosZ2f='TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC'
nosZ2r='AGGTCACATCAACGTCAACG'

#nini=regex.compile(nosZ2r{e<=3})

nimekiri=list(f)
pikkus=len(nimekiri)

count = 0
while (count < pikkus):
    line = nimekiri[count].rstrip('\n')
    m=regex.findall("(TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC){e<=3}", line)
    n=regex.findall("AGGTCACATCAACGTCAACG{e<=3}", line) 
    if bool(m) & bool(n):
        print nimekiri[count-1].rstrip('\n')
        print line
    count = count + 1

f.close()

正如您所看到的，具有3个错误的模糊性的正则表达式可以正常工作。但我被迫手动输入整个字符串（nosZ2f / r）到findall。我无法编译带有错误/模糊值的正则表达式。

将字符串（行nosZ2f / r）转换为具有3个错误的模糊值的正则表达式模式的正确语法是什么？（在评论行看到失败的尝试）

使用输入字符串作为regexp源的可能性对于我想到的任何实际有用的脚本都是至关重要的。（否则自动化程度不高）所以如果我能用frex，我会很高兴。替换

m=regex.findall("(TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC){e<=3}", line)

带

m=regex.findall(nini, line) etc.

或

m=regex.findall("string{e<=3}", line)

Answer 1

你需要正确地把你的字符串放在一起。

import regex
testString = 'some phrase'
r = regex.compile('('+testString+'){e<=5}')
r.match('phrase')

如果要构建正则表达式模式，则需要使用各种字符串操作技术来构建要使用的适当模式。

使用python正则表达式编译模糊正则表达式

1 个答案: