如何使用信息增益对基因进行排名？

Question

如何使用信息增益和卡方统计对微阵列数据进行基因排序？请用一个简单的例子说明..

Answer 1

您可以使用开源机器学习软件Weka。加载数据集并转到“选择属性”选项卡。使用以下属性评估程序：

ChiSquaredAttributeEval ：通过计算与班级相关的卡方统计量的值来评估属性的价值。

InfoGainAttributeEval ：通过衡量与班级相关的信息收益来评估属性的价值。

..在“搜索方法”中使用 Ranker 。这样，属性按其各自的评估进行排名

Answer 2

我不完全理解您的问题，但可以在此处找到用于分析微阵列数据的非常成功的包：

BioConductor

这是一个软件项目，具有各种不同的模块，用于从微阵列读取数据和执行统计分析。这非常有用，因为随着技术的发展，微阵列数据的文件格式不断变化，并且用于分析微阵列数据的算法也已经显着提高。

Answer 3

您可以使用InfoGainAttributeEval来计算信息收益 以及更多信息check this answer