C:将2D双数组转换为java 2D双数组

时间:2014-01-11 17:59:48

标签: java c arrays java-native-interface minidump

我正在尝试在java中运行本机方法,然后接收我可以在java中使用的2D双数组。我已经成功地操纵了C中的数据,但现在我需要将它发送回java。我如何将C中的2D双数组转换为java中的2D双数组?

我尝试过这个简单的代码,但不幸的是它不起作用:

jobjectArray convertToArray(JNIEnv *env, double **data, int length1D,
            int *length2D) {
        jsize outerSize = (jsize) length1D; /* EDIT thanks to John Bickers */
        jclass class = (*env)->FindClass(env, "[D"); /* EDIT thanks to Nam San */
        jobjectArray outer = (*env)->NewObjectArray(env, outerSize, class, 0);
        jsize i;
        for (i = 0; i < outerSize; i++) {
            jsize innerSize = (jsize) length2D[i]; /* EDIT thanks to John Bickers */
            jdoubleArray inner = (*env)->NewDoubleArray(env, innerSize);
            (*env)->SetDoubleArrayRegion(env, inner, 0, innerSize, data[i]);
            (*env)->SetObjectArrayElement(env, outer, i, inner);
            (*env)->DeleteLocalRef(env, inner); /* EDIT thanks to Tom Blodget */
        }
        return outer;
    }

这就是名为'getLength'的宏:

#define getLength(x)  (sizeof(x) / sizeof(x[0]))

当我运行它时会创建一个mindump(我无法理解):

我是JNI和C编程的新手,所以请解释相当详细的究竟是什么错误以及如何修复它。

提前致谢!

更新 我发现错误不是关于代码本身,更多是关于我试图转换的数组。事实证明,数组中的一个元素包含的元素比其他元素多。我试图在图书馆matio的帮助下从4级matlab文件中读取。也许错误位于那里?我会把所有内容放在下面:

#include <jni.h>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>
#include <matio.h>
#include "ReadMatFile.h"

//macros
#define getLength(x)  (sizeof(x) / sizeof(x[0]))

//variables
double *dataMatrix[4];
int innerSize[getLength(dataMatrix)];

//functions
jobjectArray convertToArray(JNIEnv *env, double **data, int length1D,
        int *length2D);

JNIEXPORT jobjectArray JNICALL Java_ReadMatFile_readMatFile(JNIEnv *env,
        jobject object, jstring str) {
    const char *fileName = (*env)->GetStringUTFChars(env, str, 0);
    mat_t *matfp;
    matvar_t *matvar;
    printf("%s\n", fileName);
    matfp = Mat_Open(fileName, MAT_ACC_RDONLY | MAT_FT_MAT4);
    if ( NULL == matfp) {
        fprintf(stderr, "Error opening MAT file %s\n", fileName);
        return NULL;
    }
    int i = 0;
    while ( NULL != (matvar = Mat_VarReadNext(matfp))) {
        double *data = (double*) (matvar->data);
        dataMatrix[i] = data;
        innerSize[i] = (int) matvar->nbytes / matvar->data_size;
        Mat_VarFree(matvar);
        matvar = NULL;
        i++;
    }
    Mat_Close(matfp);
    (*env)->ReleaseStringUTFChars(env, str, fileName);
    int outerSize = (int) getLength(dataMatrix);
    return convertToArray(env, dataMatrix, outerSize, innerSize);
}

jobjectArray convertToArray(JNIEnv *env, double **data, int length1D,
        int *length2D) {
    jsize outerSize = (jsize) length1D;
    jclass class = (*env)->FindClass(env, "[D");
    jobjectArray outer = (*env)->NewObjectArray(env, outerSize, class, 0);
    jsize i;
    for (i = 0; i < outerSize; i++) {
        jsize innerSize = (jsize) length2D[i];
        jdoubleArray inner = (*env)->NewDoubleArray(env, innerSize);
        (*env)->SetDoubleArrayRegion(env, inner, 0, innerSize, data[i]);
        (*env)->SetObjectArrayElement(env, outer, i, inner);
        (*env)->DeleteLocalRef(env, inner);
    }
    return outer;
}

另一次更新

似乎错误出现在数组的第一个元素中。我确定这一点,因为如果我在另一个数组上运行代码的值较少,那么它的工作原理非常好。但是,如果我尝试运行此代码,我只返回第一个数组,它会创建一个minidump:

#include <jni.h>
#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>
#include <matio.h>
#include "ReadMatFile.h"

//macros
#define getLength(x)  (sizeof(x) / sizeof(x[0]))

//variables
double *dataMatrix[4];
int innerSize[getLength(dataMatrix)];

//functions
jobjectArray convertTo1DArray(JNIEnv *env, double *data, int length);

JNIEXPORT jdoubleArray JNICALL Java_ReadMatFile_readMatFile(JNIEnv *env,
        jobject object, jstring str) {
    const char *fileName = (*env)->GetStringUTFChars(env, str, 0);
    mat_t *matfp;
    matvar_t *matvar;
    matfp = Mat_Open(fileName, MAT_ACC_RDONLY | MAT_FT_MAT4);
    if ( NULL == matfp) {
        fprintf(stderr, "Error opening MAT file %s\n", fileName);
        return NULL;
    }
    int i = 0;
    while ( NULL != (matvar = Mat_VarReadNext(matfp))) {
        double *data = (double*) (matvar->data);
        dataMatrix[i] = data;
        innerSize[i] = (int) matvar->nbytes / matvar->data_size;
        Mat_VarFree(matvar);
        matvar = NULL;
        i++;
    }
    Mat_Close(matfp);
    (*env)->ReleaseStringUTFChars(env, str, fileName);
    return convertTo1DArray(env, dataMatrix[1], innerSize[1]);
}

jobjectArray convertTo1DArray(JNIEnv *env, double *data, int length) {
    jdoubleArray arr = (*env)->NewDoubleArray(env, (jsize) length);
    (*env)->SetDoubleArrayRegion(env, arr, 0, (jsize) length, data);
    (*env)->DeleteLocalRef(env, arr);
    return arr;
}

但是,如果我在数组中的下一个元素上运行代码(即索引1而不是索引0)它不会创建minidump,也不会返回数组。它创建一个minidump的原因很可能是因为第一个数组包含从level-4 matlab文件中检索的1000004个double值。所以大家都知道这个问题已经解决了。但不幸的是,我描述的问题仍然存在(即它仍然创建了minidump)。所以,谢谢大家,我可能会发布另一个关于巨大阵列问题的问题。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

一个大问题是getLength(数据)没有返回您期望的内容。因为函数被赋予指向double的指针,sizeof(x)是指向指针的指针的大小,而sizeof(x [0])是指向double的指针的大小。结果很可能是1.在函数内部,您的代码无法分辨数据矩阵的维数。

您应该更改函数以使数据只是一个double *,再添加两个参数来提供两个数组维度innerSize和outerSize,并在调用SetDoubleArrayRegion()时执行一些算法以将索引转换为数据。

答案 1 :(得分:1)

这是How to return 2D long array with JNI的副本,除了您需要2D双数组而不是2D长数组。对于2D双阵列,您FindClass()  方法需要找到"[D"而不是"java/lang/Double"