Question

我已经在Ubuntu 12.04上成功安装了MPICH，并且可以按照预期编译和运行简单的测试C程序。

现在我正在尝试使用pip来安装mpi4py，只需通过pip install mpi4py即可。我首先执行了sudo apt-get build-dep python-mpi4py，但工作正常。

我正在使用virtualenv，所以这个mpi4py安装不是sudo（也不应该）。

这是在一组冗长的控制台输出后看到的命令和错误，看起来像普通的编译内容（如果需要，我可以打印所有控制台输出，但我认为大部分都是是标准的编译器警告，表明没有问题。）

(local-dev)espears@espears-w:~$ pip install mpi4py
src/ext/mpi_swig.c: In function ‘SWIG_Python_AddErrorMsg’:

src/ext/mpi_swig.c:859:5: error: format not a string literal and no format arguments [-Werror=format-security]

cc1: some warnings being treated as errors

error: command '/usr/bin/mpicc' failed with exit status 1

----------------------------------------
Cleaning up...
Command /home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/python -c "import setuptools, tokenize;__file__='/home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py/setup.py';exec(compile(getattr(tokenize, 'open', open)(__file__).read().replace('\r\n', '\n'), __file__, 'exec'))" install --record /tmp/pip-5o6OwN-record/install-record.txt --single-version-externally-managed --compile --install-headers /home/espears/.virtualenvs/local-dev/include/site/python2.7 failed with error code 1 in /home/espears/.virtualenvs/local-dev/build/mpi4py
Traceback (most recent call last):
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/bin/pip", line 11, in <module>
    sys.exit(main())
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/__init__.py", line 185, in main
    return command.main(cmd_args)
  File "/home/espears/.virtualenvs/local-dev/local/lib/python2.7/site-packages/pip/basecommand.py", line 161, in main
    text = '\n'.join(complete_log)
UnicodeDecodeError: 'ascii' codec can't decode byte 0xe2 in position 31: ordinal not in range(128)

但是，which mpicc给出了预期的结果：/usr/bin/mpicc并且如上所述，如果我使用此mpicc编译简单的.c测试程序，它们可以正常工作。

我已经看到一些描述用于编译MPI的标志选项fPIC的链接，但是，我只是使用apt-get来安装MPI，并且特别希望只依赖于本机Ubuntu包这些工具，而不是维护单独的安装说明以手动构建它们。

如何在mpicc安装过程中确定mpi4py失败的原因？

加

控制台输出中的以下内容似乎是导致问题的编译命令。

building 'mpi4py._mpi_swig' extension

/usr/bin/mpicc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c src/ext/mpi_swig.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/ext/mpi_swig.o

当我自己从命令行尝试时，这会出现以下错误：

(local-dev)espears@espears-w:~$ /usr/bin/mpicc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -g -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Wformat-security -Werror=format-security -fPIC -I/usr/include/python2.7 -c src/ext/mpi_swig.c -o build/temp.linux-x86_64-2.7/src/ext/mpi_swig.o
gcc: error: src/ext/mpi_swig.c: No such file or directory
gcc: fatal error: no input files
compilation terminated.

Answer 1

我能够成功解决这个问题，只需将pip指向MPI4PY包网址，而不是包名称，就不会对系统中的任何内容进行任何更改：

pip install https://bitbucket.org/mpi4py/mpi4py/downloads/mpi4py-1.3.1.tar.gz

Answer 2

在带有openmpi-4.0.0的Ubuntu 18.04上遇到了类似的问题。通过安装旧版本的openmpi-2.1.6解决。

apt-get install openmpi=2.1.6

安装mpi4py时出现MPICC错误，尽管MPICC安装正确且正常

2 个答案: