如何按组选择具有最小值并在R中包含NA的行

时间:2014-01-10 14:10:48

标签: r dataframe na

以下是一个例子:

set.seed(123)    
data<-data.frame(X=rep(letters[1:3], each=4),Y=sample(1:12,12),Z=sample(1:100, 12))
data[data==3]<-NA

我要意识到的是,通过忽略X来选择Y的唯一行NA:{/ p>

a 4 68
b 1 4
c 2 64

最好的方法是什么?

4 个答案:

答案 0 :(得分:7)

使用data.table包,这很简单:

library(data.table)

d <- data.table(data)
d[, min(Y, na.rm=TRUE), by=X]

您还可以使用plyr及其ddply功能:

library(plyr)

ddply(data, .(X), summarise, min(Y, na.rm=TRUE))

或使用基础R:

aggregate(X ~ ., data=data, FUN=min)

根据编辑,我肯定会使用data.table

d[, .SD[which.min(Y)], by=X]

但是,有使用基本R或其他软件包的解决方案。

答案 1 :(得分:1)

这不会使用索引选择行,但会返回您想要的值...

ddply(data, .(X), summarise, min=min(Y, na.rm=T))

  X min
1 a   5
2 b   1
3 c   4

评论后编辑:要选择整行,您可以:

ddply(data, .(X), function(x) arrange(x, Y)[1, ])

  X Y  Z
1 a 4 68
2 b 1  4
3 c 2 64

data$index <- 1L:nrow(data)
i <- by(data, data$X, function(x) x$index[which.min(x$Y)] )
data[i, ]

   X Y  Z index
1  a 4 68     1
6  b 1  4     6
10 c 2 64    10

答案 2 :(得分:0)

对每个字母使用子集可能会有所帮助

data<-data.frame(X=rep(letters[1:3], each=4),Y=sample(1:12,12))
dataA <- subset(data, data$X=="a")
min(dataA$Y, na.rm=TRUE)

答案 3 :(得分:0)

有一种data.table方式

library(data.table)
set.seed(123)    
data<-data.frame(X=rep(letters[1:3], each=4),Y=sample(1:12,12),Z=sample(1:100, 12))
data[data==3]<-NA
data <- data.table(data)
data[data[,.I[which.min(Y)], by = "X"][,V1]]