R总结两列的完整情况

时间:2014-01-10 09:14:23

标签: r matrix sum apply rollapply

如何计算两列完整案例的数量?

c等于:

      a  b
[1,] NA NA
[2,]  1  1
[3,]  1  1
[4,] NA  1

应用类似

的内容
rollapply(c, 2, function(x) sum(complete.cases(x)),fill=NA)

在这种情况下,我想找回一个号码2。这将适用于包含许多列的大型数据集,因此我希望在整个集合中使用rollapply,而不是简单地执行sum(complete.cases(a,b))

我在想它吗?

谢谢!

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

你试过sum(complete.cases(x))吗?!

set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 15 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3]
#[1,]    1   NA    5
#[2,]    4    3    2
#[3,]    2    5    4
#[4,]    5    3    3
#[5,]    5    2   NA


sum(complete.cases(x))
#[1] 3

要查找前两列的complete.cases()

sum(complete.cases(x[,1:2]))
#[1] 4

在整个矩阵的applymatrix的两列,你可以这样做:

#  Bigger data for example
set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 50 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
#[1,]    1   NA    5    5    5    4    5    2   NA    NA
#[2,]    4    3    2    1    4    3    5    4    2     1
#[3,]    2    5    4   NA    3    3    4    1    2     2
#[4,]    5    3    3    1    5    1    4    1    2     1
#[5,]    5    2   NA    5    3   NA   NA    1   NA     5

# Column indices
id <- seq( 1 , ncol(x) , by = 2 )
[1] 1 3 5 7 9
apply( cbind(id,id+1) , 1 , function(i) sum(complete.cases(x[,c(i)])) )
[1] 4 3 4 4 3
对于那些没有遗漏任何数据的行,

complete.cases()在整个data.framematrix返回TRUE的行中逐行工作。除了一个小问题,"c"是一个错误的变量名称,因为c()是最常用的函数之一。

答案 1 :(得分:1)

您可以使用rollapply计算相邻矩阵列中的完整个案数量,如下所示:

m <- matrix(c(NA,1,1,NA,1,1,1,1),ncol=4)
#     [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,]   NA    1    1    1
#[2,]    1   NA    1    1

library(zoo)

rowSums(rollapply(is.na(t(m)), 2, function(x) !any(x)))
#[1] 0 1 2

答案 2 :(得分:0)

这适用于matrixdata.frame

> sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))

[1] 2

你可以简单地遍历大矩阵M

for (i in 1:(ncol(M)-1) ){
    c <- M[,c(i,i+1]
    agreement <- sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))
}