如何计算两列完整案例的数量?
c
等于:
a b
[1,] NA NA
[2,] 1 1
[3,] 1 1
[4,] NA 1
应用类似
的内容rollapply(c, 2, function(x) sum(complete.cases(x)),fill=NA)
在这种情况下,我想找回一个号码2
。这将适用于包含许多列的大型数据集,因此我希望在整个集合中使用rollapply
,而不是简单地执行sum(complete.cases(a,b))
。
我在想它吗?
谢谢!
答案 0 :(得分:2)
你试过sum(complete.cases(x))
吗?!
set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 15 , TRUE ) , 5 )
# [,1] [,2] [,3]
#[1,] 1 NA 5
#[2,] 4 3 2
#[3,] 2 5 4
#[4,] 5 3 3
#[5,] 5 2 NA
sum(complete.cases(x))
#[1] 3
要查找前两列的complete.cases()
:
sum(complete.cases(x[,1:2]))
#[1] 4
在整个矩阵的apply
到matrix
的两列,你可以这样做:
# Bigger data for example
set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 50 , TRUE ) , 5 )
# [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
#[1,] 1 NA 5 5 5 4 5 2 NA NA
#[2,] 4 3 2 1 4 3 5 4 2 1
#[3,] 2 5 4 NA 3 3 4 1 2 2
#[4,] 5 3 3 1 5 1 4 1 2 1
#[5,] 5 2 NA 5 3 NA NA 1 NA 5
# Column indices
id <- seq( 1 , ncol(x) , by = 2 )
[1] 1 3 5 7 9
apply( cbind(id,id+1) , 1 , function(i) sum(complete.cases(x[,c(i)])) )
[1] 4 3 4 4 3
对于那些没有遗漏任何数据的行, complete.cases()
在整个data.frame
或matrix
返回TRUE
的行中逐行工作。除了一个小问题,"c"
是一个错误的变量名称,因为c()
是最常用的函数之一。
答案 1 :(得分:1)
您可以使用rollapply
计算相邻矩阵列中的完整个案数量,如下所示:
m <- matrix(c(NA,1,1,NA,1,1,1,1),ncol=4)
# [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,] NA 1 1 1
#[2,] 1 NA 1 1
library(zoo)
rowSums(rollapply(is.na(t(m)), 2, function(x) !any(x)))
#[1] 0 1 2
答案 2 :(得分:0)
这适用于matrix
和data.frame
> sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))
[1] 2
你可以简单地遍历大矩阵M
for (i in 1:(ncol(M)-1) ){
c <- M[,c(i,i+1]
agreement <- sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))
}