如何在NumPy中规范化数组?

时间:2014-01-09 20:25:04

标签: python numpy scikit-learn statistics normalization

我想拥有一个NumPy数组的规范。更具体地说,我正在寻找此功能的等效版本

def normalize(v):
    norm = np.linalg.norm(v)
    if norm == 0: 
       return v
    return v / norm

skearnnumpy中有类似内容吗?

此函数适用于v为0向量的情况。

12 个答案:

答案 0 :(得分:111)

如果您正在使用scikit-learn,则可以使用sklearn.preprocessing.normalize

import numpy as np
from sklearn.preprocessing import normalize

x = np.random.rand(1000)*10
norm1 = x / np.linalg.norm(x)
norm2 = normalize(x[:,np.newaxis], axis=0).ravel()
print np.all(norm1 == norm2)
# True

答案 1 :(得分:35)

我同意如果这样的功能是附带电池的一部分,那就太好了。但据我所知,事实并非如此。这是任意轴的版本,并提供最佳性能。

import numpy as np

def normalized(a, axis=-1, order=2):
    l2 = np.atleast_1d(np.linalg.norm(a, order, axis))
    l2[l2==0] = 1
    return a / np.expand_dims(l2, axis)

A = np.random.randn(3,3,3)
print(normalized(A,0))
print(normalized(A,1))
print(normalized(A,2))

print(normalized(np.arange(3)[:,None]))
print(normalized(np.arange(3)))

答案 2 :(得分:16)

您可以指定ord获取L1规范。 为了避免零分割,我使用eps,但这可能不是很好。

def normalize(v):
    norm=np.linalg.norm(v, ord=1)
    if norm==0:
        norm=np.finfo(v.dtype).eps
    return v/norm

答案 3 :(得分:6)

如果您有多维数据并希望每个轴都标准化为自身:

def normalize(d):
    # d is a (n x dimension) np array
    d -= np.min(d, axis=0)
    d /= np.ptp(d, axis=0)
    return d

使用numpys peak to peak函数。

答案 4 :(得分:5)

这也可能对您有用

import numpy as np
normalized_v = v / np.sqrt(np.sum(v**2))

但在v的长度为0时失败。

答案 5 :(得分:2)

在Christoph Gohlke的流行transformations模块中,还有函数unit_vector()来规范化向量:

import transformations as trafo
import numpy as np

data = np.array([[1.0, 1.0, 0.0],
                 [1.0, 1.0, 1.0],
                 [1.0, 2.0, 3.0]])

print(trafo.unit_vector(data, axis=1))

答案 6 :(得分:1)

如果要标准化存储在3D张量中的n维特征向量,则还可以使用PyTorch:

import numpy as np
from torch import FloatTensor
from torch.nn.functional import normalize

vecs = np.random.rand(3, 16, 16, 16)
norm_vecs = normalize(FloatTensor(vecs), dim=0, eps=1e-16).numpy()

答案 7 :(得分:1)

如果您正在使用3D矢量工作,你可以做到这一点简洁使用工具区vg。它是numpy之上的一个轻层,它支持单个值和堆叠的向量。

import numpy as np
import vg

x = np.random.rand(1000)*10
norm1 = x / np.linalg.norm(x)
norm2 = vg.normalize(x)
print np.all(norm1 == norm2)
# True

我创建库在我上次启动,它是由使用的动机是这样的:简单的想法这实在是太冗长在与NumPy

答案 8 :(得分:1)

如果您使用多维数组,则可以快速解决问题。

假设我们有2D数组,我们希望通过最后一个轴对其进行归一化,而有些行的范数为零。

import numpy as np
arr = np.array([
    [1, 2, 3], 
    [0, 0, 0],
    [5, 6, 7]
], dtype=np.float)

lengths = np.linalg.norm(arr, axis=-1)
print(lengths)  # [ 3.74165739  0.         10.48808848]
arr[lengths > 0] = arr[lengths > 0] / lengths[lengths > 0][:, np.newaxis]
print(arr)
# [[0.26726124 0.53452248 0.80178373]
# [0.         0.         0.        ]
# [0.47673129 0.57207755 0.66742381]]

答案 9 :(得分:0)

您提到了sci-kit学习,所以我想分享另一个解决方案。

sci-kit学习MinMaxScaler

在sci-kit学习中,有一个名为MinMaxScaler的API,可以根据需要自定义值范围。

它还为我们处理NaN问题。

  

NaN被视为缺失值:忽略适合并保持   在转换中。 ...请参阅参考文献[1]

代码示例

代码很简单,只需键入

# Let's say X_train is your input dataframe
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
# call MinMaxScaler object
min_max_scaler = MinMaxScaler()
# feed in a numpy array
X_train_norm = min_max_scaler.fit_transform(X_train.values)
# wrap it up if you need a dataframe
df = pd.DataFrame(X_train_norm)
参考

答案 10 :(得分:0)

如果您不需要极高的精度,则可以将函数简化为:

v_norm = v / (np.linalg.norm(v) + 1e-16)

答案 11 :(得分:0)

不使用sklearn,而仅使用numpy。 只需定义一个函数即可:

假设行是变量列是样本axis= 1):

import numpy as np

# Example array
X = np.array([[1,2,3],[4,5,6]])

def stdmtx(X):
    means = X.mean(axis =1)
    stds = X.std(axis= 1, ddof=1)
    X= X - means[:, np.newaxis]
    X= X / stds[:, np.newaxis]
    return np.nan_to_num(X)

输出:

X
array([[1, 2, 3],
       [4, 5, 6]])

stdmtx(X)
array([[-1.,  0.,  1.],
       [-1.,  0.,  1.]])