Question

我正在创建一个图表，显示使用ggplot进行实验安装的可用数据。我的问题是y轴变得太拥挤，所以我希望每隔一个刻度标记更长，这样我就可以为轴标签使用更大的字体。

我的目标是绘制现场安装编号与测量时的年龄，显示所有可用数据，并按首次测量时的年龄排序。这是一个使用伪数据的例子。请注意，y轴上安装的绘图顺序基于首次测量时的年龄。

# create data frame of fake values
set.seed(1)
plots <- data.frame(installation=rep(sample(seq(1,100,1), 10), each=10),
                    age=as.vector(replicate(10, sample(seq(1,50,1), 10))))

# set up installations as factor, sorted by age at first measurement
odr <- ddply(plots, .(installation), summarize, youngest = min(age))
odr <- odr[order(odr$youngest),]
plots$installation <- factor(plots$installation, levels=rev(as.numeric(as.character(odr$installation))))
rm(odr)

# plot the available data
ggplot(plots, aes(installation, age)) + 
  geom_point() +
  coord_flip()

enter image description here

我实际上有大约60个安装和每个标签，所以它变得拥挤。通过将每隔一个y轴错开一点，我可以使用更大的字体作为标签。这是我希望得到回答的问题。

我尝试分别绘制偶数和奇数因子，然后允许我为每个因素设置轴标记，但是排序被搞砸了，我不知道为什么。如果有办法获得轴刻度效应，我会采用另一种方式，我没有采用这种方法。

# break up the data frame into odd and even factors
odds <- plots[as.numeric(plots$installation) %% 2 != 0,]
evens <- plots[as.numeric(plots$installation) %% 2 == 0,]

# try and plot odds and evens seperately
ggplot(odds, aes(installation, age)) + 
  geom_point() +
  coord_flip() +
  geom_point(data = evens, aes(installation, age))

enter image description here

谢谢！

Answer 1

好的，在上面的jhoward和this question的帮助下得到了这个结果。

诀窍是在原始图中绘制次刻度标记，然后使用annotation_custom添加主要刻度线。

使用上面的数据集：

# base plot
base <- ggplot(plots, aes(age,installation)) +
  geom_point() +
  scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[c(2,4,6,8,10)]) +
  scale_x_continuous(expand=c(0,1)) +
  theme(axis.text=element_text(size=10),
        axis.title.y=element_text(vjust=0.1))

# add the tick marks at every other facet level
for (i in 1:length(plots$installation)) {
  if(as.numeric(plots$installation[i]) %% 2 != 0) {
    base = base + annotation_custom(grob = linesGrob(gp=gpar(col= "dark grey")),  
                              ymin = as.numeric(plots$installation[i]), 
                              ymax = as.numeric(plots$installation[i]), 
                              xmin = -1.5, 
                              xmax = 0)
  }
}

# add the labels at every other facet level
for (i in 1:length(plots$installation)) {
  if(as.numeric(plots$installation[i]) %% 2 != 0) {
    base = base + annotation_custom(grob = textGrob(label = plots$installation[i], 
                                                    gp=gpar(col= "dark grey", fontsize=10)),  
                                    ymin = as.numeric(plots$installation[i]), 
                                    ymax = as.numeric(plots$installation[i]), 
                                    xmin = -2.5, 
                                    xmax = -2.5)
  }
}

# create the plot
gt <- ggplot_gtable(ggplot_build(base))
gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
grid.draw(gt)

enter image description here

Answer 2

这样的东西会标记每个其他标记：

 ggplot(plots, aes(age,installation))+
   geom_point()+
   scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[c(2,4,6,8,10)])

这适用于一般情况：

lvls <- levels(plots$installation)
brks <- 2*(1:(length(lvls)/2)) 
ggplot(plots, aes(age,installation))+
  geom_point()+
  scale_y_discrete(breaks=levels(plots$installation)[brks])

ggplot编辑中轴刻度标记的交替长度：主刻度线和次刻度标记

2 个答案: