Question

我想在我的ipython Notebook中运行一个bash脚本，并将输出保存为python变量中的字符串，以便进一步操作。基本上我想将bash魔法的输出传递给变量，例如，输出如下：

%%bash
some_command [options] foo bar

Answer 1

如何使用它：

myvar = !some_command --option1 --option2 foo bar

而不是%%bash魔法？使用!符号将以下命令作为shell命令运行，结果全部存储在myvar中。要运行多个命令并收集所有命令的输出，只需将快速shell脚本放在一起。

Answer 2

为了完整性，如果您仍想使用%%bash单元格法术，则可以传递--out和--err标志以将输出从stdout和stderr重定向到变量你的选择。

来自doucumentation：

%%bash --out output --err error
echo "hi, stdout"
echo "hello, stderr" >&2

会将输出存储在变量output和error中，以便：

print(error)
print(output)

将打印到python控制台：

hello, stderr
hi, stdout

Answer 3

注意@MattDMo（SList）和@oLas（str）答案之间变量类型的差异：

In [1]: output = !whoami

In [2]: type(output)
Out[2]: IPython.utils.text.SList

In [3]: %%bash --out output
   ...: whoami

In [4]: type(output)
Out[4]: str

管道Ipython魔术输出到变量？

3 个答案: