从文件中删除特定的行块

Question

我有这个结构的文件

>ID1
ID1info-----------
------------------
------------------

>ID2
ID1info-----------
------------------
------------------
------------------
------------------
>ID3
ID1info-----------
------------------
------------------
------------------
....

我有另一个这样的文件

ID1
ID4
..

现在我要做的是从文件1中删除那些与文件2中的ID相匹配的ID。因此，对于例如文件1，我想要删除

>ID1
ID1info-----------
------------------
------------------

我怎样才能以有效的方式做到这一点。我有一种天真的方式，需要几天时间。

我的文件1有285,000个ID，文件2有47,000个ID

Answer 1

awk 'NR==FNR{a[">"$0]}/^>/{p=!($0 in a)}p' file2 file1