在qplot中制作有序热图（ggplot2）

Question

我正在从相关性制作热图。我有两列表示ID，第三列表示这两个数据点之间的相关性。我正在努力让qplot保持我的数据在文件中的顺序。链接到数据：

https://www.dropbox.com/s/3l9p1od5vjt0p4d/SNPS.txt?n=7399684

以下是我用来制作剧情的代码：

test <- qplot(x=x, y=y, data=PCIT, fill = col1, geom = "tile")

我已经尝试了几个订单选项，但他们似乎没有做到这一点？想法？

谢谢和节日快乐

Answer 1

您需要将因子x和y的级别设置为您想要的顺序（因为它们来自文件）。试试

PCIT$x <- factor(PCIT$x, levels=unique(as.character(PCIT$x)))

与y类似。