R - 绘制netcdf气候数据

Question

我一直在尝试绘制以下网格化netcdf文件：“air.1999.nc”在以下网站上找到：

http://www.esrl.noaa.gov/psd/data/gridded/data.ncep.html

我根据我在这里和其他地方找到的答案尝试了下面的代码，但没有运气。

library(ncdf);
temp.nc <- open.ncdf("air.1999.nc");
temp <- get.var.ncdf(temp.nc,"air");

temp.nc$dim$lon$vals -> lon
temp.nc$dim$lat$vals -> lat

lat <- rev(lat)
temp <- temp[nrow(temp):1,]

temp[temp==-32767] <- NA
temp <- t(temp)

image(lon,lat,temp)
library(maptools)
data(wrld_simpl)
plot(wrld_simpl, add = TRUE)

此代码来自此处的代码：The variable from a netcdf file comes out flipped

有没有人对使用这些类型的netcdf文件有任何想法或经验？感谢

Answer 1

在您链接的问题中，lat <- rev(lat)到temp <- t(temp)的整个部分非常特定于特定的OP数据集，并且绝对没有普遍价值。

temp.nc <- open.ncdf("~/Downloads/air.1999.nc")
temp.nc
[1] "file ~/Downloads/air.1999.nc has 4 dimensions:"
[1] "lon   Size: 144"
[1] "lat   Size: 73"
[1] "level   Size: 12"
[1] "time   Size: 365"
[1] "------------------------"
[1] "file ~/Downloads/air.1999.nc has 2 variables:"
[1] "short air[lon,lat,level,time]  Longname:Air temperature Missval:32767"
[1] "short head[level,time]  Longname:Missing Missval:NA"

从这些信息中可以看出，在您的情况下，缺失值由值32767表示，因此以下应该是您的第一步：

temp <- get.var.ncdf(temp.nc,"air")
temp[temp=="32767"] <- NA

另外，在您的情况下，您的数据有4个维度，而不仅仅是2个，它们是经度，纬度，等级（我假设代表高度）和时间。

temp.nc$dim$lon$vals -> lon
temp.nc$dim$lat$vals -> lat
temp.nc$dim$time$vals -> time
temp.nc$dim$level$vals -> lev

如果您查看lat，您会看到值是反向的（image会皱眉），所以让我们反过来：

lat <- rev(lat)
temp <- temp[, ncol(temp):1, , ] #lat being our dimension number 2

然后经度表示从0到360这不是标准的，应该是从-180到180所以让我们改变：

lon <- lon -180

现在让我们将数据绘制为1000（即第一个）和第一个日期的数据：

temp11 <- temp[ , , 1, 1] #Level is the third dimension and time the fourth.
image(lon,lat,temp11) 

然后让我们叠加一张世界地图：

library(maptools)
data(wrld_simpl)
plot(wrld_simpl,add=TRUE)