我在Centos 6.4上使用PHP版本5.4.20。
在var/www/html/oldDirecory/index.php中，我开始使用syslog(LOG_INFO,__FILE__);。
使用PHP，我使用以下命令重命名目录：
rename(dirname(__FILE__).'/oldDirectory', dirname(__FILE__).'/newDirectory');
我的脚本然后使用JS使用window.location重定向到新的URL。下次服务器被点击时，syslog(LOG_INFO,__FILE__);仍显示旧目录！
使用Bash命令行，我看到目录名已被更改。
我使用vi编辑文件，不做任何更改，然后保存，然后__FILE__显示正确的目录。
我尝试制作一个简单的脚本（没有JS重定向，几个includes()等），但似乎无法复制行为。我不认为这曾经发生在早期的PHP版本中，但它可能是我添加的其他东西。也许与缓存有关？抱歉缺乏信息，但我很难过！
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您使用的是像APC一样的操作码缓存吗？如果是，请在重命名包含目录后touch受影响的文件。它在解析时进行评估，但操作码缓存存储解析的结果。
我成功地用APC复制了您的问题。据推测，使用文件名和inode数字匹配以及没有修改时间更改使其达到缓存。使用touch更改修改时间应该可以解决问题。