我正在使用car包中的scatterplot函数来生成散点图。 我希望能够在图中生成一个应该是x = y的参考线。 我尝试使用abline,它确实添加了一行,但它不是x = y行。有人可以帮忙吗?
我的代码如下:
scatterplot(phenos$P1~pheno$P0, data=pheno,spread=FALSE,ylab="6 month timepoint", xlab="Baseline Timepoint", jitter=list(x=1, y=1))
abline(0,1)
感谢。
答案 0 :(得分:5)
您可以通过相同的功能abline
实现目标。使用函数abline(a=0, b=1)
,其中a
和b
分别是该行的截距和斜率。这会为您绘制Y = a + b*x
形式的直线。
希望这会有所帮助。
答案 1 :(得分:3)
我只是使用segment函数: 段(X0 = 0,Y0 = 0时,X1 = 45,Y1 = 45)
只需使y值远远超过绘图的极限即可。
此功能也很不错,因为它不会更改x和y限制,因此线条可以在图形中清晰运行,而无需准确选取x和y值。
答案 2 :(得分:1)
这实际上相当困难/ hackish,因为scatterplot()
内部使用layout
,这使得很难控制图形驱动程序当前使用的子图。 (更新:它比我想象的更难 - 设置par("mfg")
一定是偶然或多或少地工作。)
补充数据(更新:使用平均值x和y不等于零并且彼此不相等的数据,因为它说明了天真地使用abline()
更加明显的困难)< / p>
set.seed(1)
d <- data.frame(x=rnorm(10,mean=10),y=rnorm(10,mean=12))
library(car)
尝试我的旧策略(实际上不起作用,或者只是不可预测地工作):
scatterplot(y~x,data=d,reset.par=FALSE)
k <- 1
for (i in 1:2) {
for (j in 1:2) {
par(mfg=c(i,j,2,2))
abline(0,1,lwd=3,col=k)
k <- k+1
}
}
根据我的工作方式,我会收到警告和错误或虚假答案。我是否在函数内进行scatterplot()
调用似乎很重要...... ??
第二次尝试,更保守地:从头开始重建布局。
scatterplot(y~x,data=d)
uu <- par("usr")
## mimic layout frolm car:::scatterplot.default. Would be different if we were drawing only one
## of x-boxes or y-boxes
layout(matrix(c(1, 0, 3, 2), 2, 2), widths = c(5, 95),
heights = c(95, 5))
oldmar <- par(mar=rep(0,4)) ## zero out margins so we can plot in sub-boxes without errors
## now skip through the first two sub-plots
par(new=TRUE); plot.new(); par(new=TRUE); plot.new()
par(oldmar) ## reset margins
## blank plot with user limits set and 'interior' axis calculations
plot(0:1,0:1,xlab="",ylab="",xlim=uu[1:2],ylim=uu[3:4],xaxs="i",yaxs="i")
## add annotation
abline(a=0,b=1,col=4,lwd=3)
考虑到此解决方案的工作量和脆弱性,实际上最好破解scatterplot
以选择性地允许另外指定abline()
,或者向维护者询问该能力......