Bash：剪切每个字符串的分隔片段

Question

我有一个包含如下所示行的文件：

GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCGGATGAGNNNNNN
GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCTCCGAGTNNNNNN
GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCCTTATATNNNNNN
GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCGAAGTGCNNNNNN
GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCAAGTTTTNNNNNN
GTTCAGAGTTCTACAGTCCGACGATCCGACGAANNNNNN

我想从每行中删除前26个和最后6个字符。我无法用vi编写一个好的正则表达式，但我不知道还能做什么。 有什么建议吗？

谢谢！

Answer 1

尝试使用grep。

这将保留最后13个字符，然后保留前7个字符，仅返回匹配字符（-o）和符合Perl的-P标志：

grep -oP ".{13}$" foo.txt | grep -oP ".{7}"

Answer 2

如果你的文件名是foo，你可以使用剪切来获取你想要的字符范围：

$ cut -c27-33 foo

这会产生：

GGATGAG
TCCGAGT
CTTATAT
GAAGTGC
AAGTTTT
CGACGAA

Answer 3

cut可以使用字符范围，如果这些行是固定大小（它们看起来都是39个字符）

cut -c27-33 file.txt