我是生物信息学的学生，我使用此命令使用OrthoMCL工具
./orthomclLoadBlast my_orthomcl/orthomcl.config my_orthomcl/similarSequence.txt
但我收到了错误
无法连接到数据源'：mysqllocalinfile = 1'，因为我不能 找出要使用的驱动程序（它似乎不包含 'dbi：driver：'前缀和DBI_DRIVER env var未设置）at /home/linux/Desktop/orthomclSoftware-v2.0.9/bin/../lib/perl/OrthoMCLEngine/Main/Base.pm 第56行
DBI已安装在我的系统中，为什么会出现此错误？我该如何解决？
答案 0 :(得分：1)
您需要为DBI模块安装数据库驱动程序才能使用您的数据库。在这种情况下，您似乎需要安装DBD::mysql。
OrthoMCL可能会省略驱动程序名称并仅使用dbi::，在这种情况下，您必须将环境变量DBI_DRIVER设置为mysql。
正确答案必须在OrthoMCL的文档中。你看过了吗？
<强>更新
查看source for orthomclLoadBlast，看起来您的配置文件有问题。这里有人可能熟悉该实用程序，但您必须发布orthomcl.config才有机会获得任何有用的建议。
答案 1 :(得分：0)
你应该使用mysql作为驱动程序：
样品：
use DBI;
$dbh = DBI->connect('dbi:mysql:DBNAME','root','password')