Question

我一直在写代码，我有一个问题。

我有2个文本文件.txt，看起来像这样：

档案号。 1（fasta）

DOJHLOP01DWJWJ 
TCGATTCTATGGAGGGATGCTGGCAAGGCTCCGGAAGCAGCATCAGCAATTAAAAAAT
DOJHLOP01C1GFF 
TTTACACAGTTGCAAGCCCTGAAGCTTGTGCTTCGATTCTATGGAGGGATGCTGGCAA
DOJHLOP01CAI84 
AGGCGTCGCAGACAGGTTACTTATGTTTGAACATAGTGTTTACACAGTTGCAAGCCCT

档案号。 2（质量）

DOJHLOP01DWJWJ 
32 31 29 26 30 27 32 32 31 30 28 26 26 28 27 19 26 31 24 32 31 30 25 25 29 
DOJHLOP01C1GFF
28 28 16 26 31 32 31 28 32 31 27 30 31 29 23 32 29 28 16 31 31 29 24 32 31 
DOJHLOP01CAI84 
31 30 25 30 27 24 31 31 31 32 32 31 30 24 27 21 31 27 32 31 30 25 25 28 31

正如ypu所见，每一行都是相同的，并且由于我想得到输出文件，其中包含不同的等效行，i.ex。

TCGATTCTATGGAGGGATGCTGGCAAGGCTCCGGAAGCAGCATCAGCAATTAAAAAAT
32 31 29 26 30 27 32 32 31 30 28 26 26 28 27 19 26 31 24 32 31 30 25 25 29

我已经使用vector编写了代码，但是出了点问题，因为我得到一个空白文件作为输出。拜托，帮助我！

#include <iostream>
#include <fstream>
#include <string>
#include <vector>

using namespace std;

int main()
{
        string fasta,qual;
        vector <string> v1,v2;
        ifstream file;
        fstream out_file;
        int i;

        cout <<"insert the name of fasta file"<<endl;
        cin>>fasta;
        cout<<"instert the name of qual file"<<endl;
        cin>>qual;

        file.open(fasta.c_str(),ifstream::in);
        while(getline(file,fasta))
        {
            v1.push_back(fasta);
        }
        file.close();

        file.open(qual.c_str(),ifstream::in);
        while(getline(file,qual))
        {
            v2.push_back(qual);
        }
        file.close();

        out_file.open ("out_file.txt");

        for(i=0;i<v1.size();i++) //assuming the qual and fasta have the same numer of lines
        {
                if(v1[i]!=v2[i]) //if two lines are different
                {
                        out_file<<v1[i]; //write this line into the out_file
                        out_file<<'\n';
                        out_file<<v2[i]; //write this line into the out_file
                        out_file<<'\n';
                }

        }

        out_file.close();

        return 0;
}

非常感谢您的帮助！

Answer 1

更改fstream out_file; 到ofstream out_file;

比较2个文本文件

1 个答案: