内存限制opencpu / R.

Question

我对opencpu有一个奇怪的问题。我正在设置一个使用xcms（R-package）的web接口，当用web接口读取mzxml文件时，我得到错误：无法分配大小为207.2 Mb的向量。这看起来像是来自R的错误，但是如果我在服务器上打开R并尝试自己打开文件它可以工作，R创建和435Mb的对象。是否设置了内存限制（apache，opencpu，R）？如果我使用ulimit -a，则最大内存大小设置为无限制。

干杯，Rico

Answer 1

是的，OpenCPU云服务器使用RLIMIT_AS包在每个请求上设置内存限制RAppArmor。这是为了防止单个用户使用服务器上的所有资源。每个进程的默认限制为1GB。您可以通过编辑来配置这些限制：

/etc/opencpu/server.conf

编辑文件后，重新启动服务器：

sudo service opencpu restart

有关rlimits的更多信息，请阅读JSS paper on RAppArmor。