升级MySQL和innodb_file_per_table

Question

我想将MySQL版本从5.5升级到5.6 我知道其中一个区别是在5.6中innodb_file_per_table设置为true 在保留现有数据的同时升级MySQL的最佳做法是什么？ 我在许多地方看到，推荐的升级方法是为数据目录创建备份，升级后返回数据目录而不是新数据。
但是我仍然会为整个数据库而不是每个表都有一个innodb文件 我确实想要这个功能（每个表有不同的innnodb文件），所以不能选择将新版5.6版本的innodb_file_per_table设置为false。