我有一个包含列p1
,p2
,...的data.table,其中包含百分比。我想在给定引用变量val
的情况下计算每列的分位数。从概念上讲,这就像:
quantile(val, p1, type = 4, na.rm = T)
quantile(val, p2, type = 4, na.rm = T)
...
我尝试使用data.table如下:
fun <- function(x, y) quantile(y, x, type = 4, na.rm = T)
dt[, c('q1', 'q2') := lapply(.SD, fun), .SDcols = c('p1', 'p2'), by = grp]
where grp is some grouping variable
但是,我无法以保持修复的方式指定y
变量。
我尝试了以下内容:
fun <- function(x, y, dt) quantile(dt[, y], x, type = 4, na.rm = T)
dt[, c('q1', 'q2') := lapply(.SD, fun, y, dt), .SDcols = c('p1', 'p2'), by = grp]
但是这样做时,在计算分位数时不会强制执行分组。它将根据y
变量的整个范围而不是组内的y
来计算分位数。这样做的正确方法是什么?
编辑:
这是一个只有一个变量的简单例子:
> dt <- data.table(y = 1:10, p1 = rep(seq(0.2, 1, 0.2), 2), g = c(rep('a', 5), rep('b', 5)))
> dt
y p1 g
1: 1 0.2 a
2: 2 0.4 a
3: 3 0.6 a
4: 4 0.8 a
5: 5 1.0 a
6: 6 0.2 b
7: 7 0.4 b
8: 8 0.6 b
9: 9 0.8 b
10: 10 1.0 b
> fun <- function(x, dt, y) quantile(dt[, y], x, type = 4, na.rm = T)
> dt[, c('q1') := lapply(.SD, fun, dt, y), .SDcols = c('p1'), by = c('g')]
> dt
y p1 g q1
1: 1 0.2 a 2
2: 2 0.4 a 4
3: 3 0.6 a 6
4: 4 0.8 a 8
5: 5 1.0 a 10
6: 6 0.2 b 2
7: 7 0.4 b 4
8: 8 0.6 b 6
9: 9 0.8 b 8
10: 10 1.0 b 10
您可以看到使用y
的整个范围计算q1。
答案 0 :(得分:0)
我发现你会将所需的百分比存储在相同的data.table中,因为你希望计算分位数的数据非常奇怪,但这里有一种方法可以使用
dt <- data.table(x=10:1,y = 1:10, p1 = rep(seq(0.2, 1, 0.2), 2), g = c(rep('a', 5), rep('b', 5)))
dt[, c('qx','qy') := Map(f = quantile, x = list(x, y), prob = list(p1), type = 4), by = g]
您可以在.SDcols
内使用.SD
来选择所需的列
dt[, c('qx','qy') := Map(f = quantile, x = .SD[, .SDcols = c('x','y')],
prob = list(p1), type = 4), by = g]
或使用with =FALSE
dt[, c('qx','qy') := Map(f = quantile, x = .SD[, c('x', 'y'), with = FALSE],
prob = list(p1), type = 4), by = g]