函数observe()和reactiveValues()如何工作?

时间:2013-11-26 15:06:15

标签: r shiny shiny-server

我有一个包含两个不同动作的表单。第一个是上传文件,第二个是示例。当我点击其中一个我的应用程序执行某些操作时,服务器会保存单击信息而不会更改,直到我单击其他按钮。

例如,如果我单击上传按钮而不选择文件,它什么都不做,但如果我选择一个文件,服务器上传文件并开始处理它而不点击上传按钮,因为服务器保存了过去点击。我想知道是否可以重置每次点击的值。

的index.html

<form class="span12 menu-med-upload">
 <div class="row-fluid">
  <h3>Upload File .fasta</h3>
  <div class="custom-input-file btn btn-inverse">
   <input type="file" size="1" name="fileFasta" id="fileFasta" class="input-file" />
   Select File
  </div>
  <img src="/static/img/check.png" class = "custom-input-check">
  <div class="span12"></div>
  <textarea class = "span12" rows  = "10" style="resize: none;" id="textAreaFasta">
  </textarea>
 </div>
 <button id="uploadFasta" type="button" class="btn btn-inverse action-button" >Upload    File</button>
 <button id="exampleFasta" type="button" class="btn btn-inverse action-button"  >Example</button>
</form>

Server.R

shinyServer(function(input, output, session) {

 # Create a reactiveValues object, to let us use settable reactive values
 values <- reactiveValues()
 # To start out, lastAction == NULL, meaning nothing clicked yet
 values$lastAction <- NULL
 # An observe block for each button, to record that the action happened
 observe({
  if (input$exampleFasta != 0) {
   values$lastAction <- 'example'
  }
 })
 observe({
  if (input$uploadFasta != 0) {
   values$lastAction <- 'upload'
  })
 })

 # Then you can use values$lastAction in reactive expressions, outputs, etc.
 output$table <- renderText({
  if (is.null(values$lastAction)) 
   return(NULL)
  if (identical(values$lastAction, 'upload'))
   return(myRenderTable(matrixProtein(), "table", nameFile))
  if (identical(values$lastAction, 'example'))
   return(myRenderTable(matrixProteinExample(), "table", ""))
  stop("Unexpected value for lastAction: ", values$lastAction)
 })
})

注意:Joe Cheng制作了server.R的代码,我复制到这个例子中工作到shiny Change data input of buttons

2 个答案:

答案 0 :(得分:5)

如果没有可重复的例子,这个问题就更难回答了。但是,我已经整理了一个自包含的示例并修复它以便它可以工作。代码有两个问题。第一个,由@xiaodai确定(但没有充分的解释)是文件上传元素不是来自被动上下文的isolate d。这意味着每次更改文件元素时,输出也会更改。第二个问题是每个按钮的代码只在连续多次单击时被调用一次,这意味着如果你没有按顺序,上传不会发生(修复isolate问题之后)首先单击“示例”按钮。

现在它起作用,因为我相信OP想要的。

这是固定的 index.html

<html>
  <head>
  <script src="shared/jquery.js" type="text/javascript"></script>
  <script src="shared/shiny.js" type="text/javascript"></script>
  <link rel="stylesheet" type="text/css" href="shared/shiny.css"/> 
</head>
<body>
<form class="span12 menu-med-upload">
 <div class="row-fluid">
  <h3>Upload File .fasta</h3>
  <div class="custom-input-file btn btn-inverse">
   <input type="file" size="1" name="fileFasta" id="fileFasta" class="input-file" />
   Select File
  </div>
 </div>
 <button id="uploadFasta" type="button" class="btn btn-inverse action-button" >Upload    File</button>
 <button id="exampleFasta" type="button" class="btn btn-inverse action-button"  >Example</button>
</form>
  <div id="table" class="shiny-html-output"></div>
</body>
</html>

这是固定的 server.R

library("xtable")
library("Biostrings")

myRenderTable <- function(data, dataType, nameFile) {
  print(xtable(data), type = "html", print.results = FALSE)
}

matrixProtein <- function(fastaFile) {
  fasta <- readDNAStringSet(fastaFile)
  alphabetFrequency(translate(fasta))
}

matrixProteinExample <- function() {
  matrixProtein(system.file("extdata", "someORF.fa", package="Biostrings"))
}

shinyServer(function(input, output, session) {

  # Create a reactiveValues object, to let us use settable reactive values
  values <- reactiveValues()
  # To start out, lastAction == NULL, meaning nothing clicked yet
  values$lastAction <- NULL
  # An observe block for each button, to record that the action happened
  # Note setting the lastAction to NULL and then to a string ensures the output
  # is generated each time the button is clicked which is necessary for the upload button
  observeEvent(input$exampleFasta, {
    values$lastAction <- "example"
  })
  observeEvent(input$uploadFasta, {
    values$lastAction <- NULL
    values$lastAction <- "upload"
  })

  nameFile <- "Random"

  # Then you can use values$lastAction in reactive expressions, outputs, etc.
  output$table <- renderText({
    if (is.null(values$lastAction)) 
      return(NULL)
    if (identical(values$lastAction, 'upload')) {
        if (!is.null(isolate(input$fileFasta))) {
          return(myRenderTable(isolate(matrixProtein(input$fileFasta$datapath)), "table", nameFile))
        } else {
          stop("No file provided")
        }
    } else if (identical(values$lastAction, 'example'))
      return(myRenderTable(matrixProteinExample(), "table", ""))
    stop("Unexpected value for lastAction: ", values$lastAction)
  })
})

请注意,这取决于Bioconductor包Biostrings和CRAN包xtable。我不知道原始函数是做什么的,但是这段代码采用了FASTA格式的文件,读取序列,翻译成蛋白质序列,然后给出一个字母表频率表。

另请注意,我不知道myRenderTable的其他参数是什么意思,所以我忽略了它们。

答案 1 :(得分:-4)

你想要孤立。所以在R控制台中键入它

?shiny::isolate