查找与目标序列不匹配的序列

Question

Rnaer来自Biostar的一个有趣问题：

  

我想找到给定长度的独特dna /蛋白质序列（例如30nt）   与C.elegans基因组的任何区域都不匹配。在那儿   任何工具吗？

Answer 1

NCBI提供了一种简便的方法来搜索与目标生物基因组不匹配但与其他数据库和来源相匹配的DNA /氨基酸序列数据库。

只需使用NCBI's BLASTn

中的exclude field即可

希望这很有用。