Question

如果有人能在这里帮助我，我真的很感激。

我使用的是python 2.7，R 3.0.1的ubuntu 13.10，我已经按照rpy2安装指南成功进行了测试。

使用此命令python -m 'rpy2.tests'通过提示运行测试时出现以下错误：

rpy2 version: 2.3.8
built against R version: 3-0.1--62743
............................................................................................ ............................................................................................ .........................................................................................................E...........................................................
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ERROR: testPandas2ri
(rpy2.robjects.tests.testPandasConversions.PandasConversionsTestCase)
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Traceback (most recent call last):
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/tests/testPandasConversions.py", line 74, in testPandas2ri
    pandas_df = robjects.conversion.ri2py(rdataf)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/rpy2/robjects/pandas2ri.py", line 63, in ri2pandas
    raise NotImplementedError("Conversion from rpy2 DataFrame to pandas' DataFrame")
NotImplementedError: Conversion from rpy2 DataFrame to pandas' DataFrame

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Ran 349 tests in 4.297s

在python解释器中安装时遇到同样的错误。我在哪里可以找到这个转换包？

Answer 1

此代码看起来有点不稳定。很明显，有很多人（包括我自己）使用rpy2和pandas，但是rpy2还没有稳定的内置转换器。您可以在当前开发版本的rpy2中尝试this module：

from rpy2.robjects.pandas2ri import pands2ri
rpy2.robjects.pandas2ri.activate()

根据源代码中的注释，上面的代码看起来还不稳定，所以最好根据该模块中的函数编写自己的代码。

你也可以试试熊猫的代码。请参阅此处以获取pandas / rpy2接口的文档（自编写本文档以来，该接口实际上已更新）：

http://pandas.pydata.org/pandas-docs/dev/r_interface.html

和源代码：

https://github.com/pydata/pandas/blob/master/pandas/rpy/common.py

例如：

import pandas.rpy.common as com
r_dataframe = com.convert_to_r_dataframe(df)

如果你无法弄清楚，请随意提出你遇到的具体问题。

rpy2测试得到＆＃34; NotImplementedError：从rpy2 DataFrame转换为pandas＆＃39;数据帧＆＃34;在ubuntu上

1 个答案: