试图猜测R的主页但在PATH中没有R命令。 OsX 10.6

Question

我正在尝试安装rpy2，而我正面临一个共同的问题。不幸的是，我找到的所有解决方案都是针对win7

我安装了Python 2.7和R 2.15。 然后我在终端上写了

easy_install rpy2

或者

pip install rpy2

结果相同：

Tried to guess R's HOME but no R command in the PATH

我应该做什么？

Answer 1

确保已安装R

brew install r

然后安装rpy

pip install rpy2

Answer 2

rpy2代码执行错误检查。 R可能完全没问题，但是rpy2使用了不可靠的检查。

要检查R，rpy2使用subprocess.check_output。但是，这是在python 2.7中引入的（AFAIK）。

如果你使用的是低于2.7的python版本，那么你应该更新到至少2.7。

如果你必须使用python 2.6，那么你应该看this answer to see how to force subprocess.check_output into python 2.6，最后允许你安装rpy2。这是我必须要做的，因为我无法更新python的版本。

下载rpy2代码，然后修改其setup.py并插入该答案中的代码。

Answer 3

1. 使用easy_install rpy2，效果很好。

http://rpy.sourceforge.net/rpy2/doc-2.2/html/overview.html#download

确保您已安装setuptools。

如果您不知道如何操作，check this link

您可以运行ez_setup.py并让它为您决定。

1. 将C：\ Program Files \ R \ R-2.12.1 \ bin \ i386（R.dll的路径）添加到环境变量PATH

2. 使用C：\ Program Files \ R \ R-2.12.1

添加环境变量R_HOME

3. 使用您的Windows用户名

添加环境变量R_USER

Answer 4

我遇到了同样的问题（在Mac上），我在网上找到的解决方案都没有。唯一对我有用的是：

conda update python

pip install rpy2

Answer 5

当我做

时，

安装对我有用

pip install rpy2

但不是我做的时候

sudo pip install rpy2

因此，如果您使用sudo并且没有提及它，这可能会对您有所帮助。我也试过从源代码手动安装，当我使用'python setup.py install'进行安装步骤时工作，但是没有使用sudo！

我在CentOS 7上用Python 2.7和R 3.2（作为root用户）做到了这一点。关于sudo的行为，请参阅this question。