qsub和python，导入.py模块但返回.pyf的ImportError

Question

我正在尝试通过qsub myScript.sh -cwd提交作业，其中shell脚本运行Python-2.7脚本myPython.py。

    # myScript.sh
    python2.7 myPython.py

现在，myPython.py需要导入存储在我的本地目录中的Python包，因此脚本以

开头

    # myPython.py
    import sys
    sys.path.append('/file/path/for/package')
    import package

提交作业后，日志文件包含Python的以下输出：

    ImportError: No module named problem_c

从*.py文件导入多个模块而不返回错误后会发生此错误，因此我相当确定这不是路径问题。我找到的唯一区别是problem_c文件以.pyf结尾（即problem_c.pyf）。它存储在与.py结尾的模块相同的目录中。

当我在本地运行脚本时，如python2.7 myPython.py，当包加载时不会发生此错误。但是，如果不将其提交到队列，则该作业的内存密集程度太高而无法完成。当我使用.pyf时，为什么写成qsub文件的模块被区别对待，在这种情况下如何导入它们？

（如果重要的话，我正在处理的集群是使用Sun Grid Engine设置的。）

感谢您的想法。

Answer 1

或者f2py。很明显，您没有在群集中添加模块。

Answer 2

以下是您可以导入带有路径的模块的方法：

import imp
module_name = imp.load_source('module_name', '/abs/path/to/module/module_name.py')

# usage
module_name.function()