将vegdist()中的关联矩阵强制转换为数据帧

时间:2013-11-18 14:18:18

标签: r vegan

我正在使用 R package vegan 中的vegdist()函数来生成物种丰度数据集的关联矩阵(生成的关联矩阵是936乘936)。我希望能够将此关联矩阵导出/提取/强制转换为可写为 .csv 的数据框或格式,以便我可以将其用于后续分析。我知道你可以使用vegdist()的输出来获得排序之后的事物,或者使用热图(coldiss())进行可视化,但在这种情况下我希望能够实际看到并操纵原始关联矩阵。

有什么想法吗?我不确定样本数据在这种情况下是否真的有用,因为它是如此庞大的数据集。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

尝试:

write.csv(as.matrix(YOUR_MATRIX), "YOUR_MATRIX.csv")