我正在使用 R package vegan 中的vegdist()
函数来生成物种丰度数据集的关联矩阵(生成的关联矩阵是936乘936)。我希望能够将此关联矩阵导出/提取/强制转换为可写为 .csv 的数据框或格式,以便我可以将其用于后续分析。我知道你可以使用vegdist()
的输出来获得排序之后的事物,或者使用热图(coldiss()
)进行可视化,但在这种情况下我希望能够实际看到并操纵原始关联矩阵。
有什么想法吗?我不确定样本数据在这种情况下是否真的有用,因为它是如此庞大的数据集。
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尝试:
write.csv(as.matrix(YOUR_MATRIX), "YOUR_MATRIX.csv")