传递一个fortran派生类型,它包含不同编译器之间的可分配数组(PGI和Intel)

时间:2013-11-15 20:05:19

标签: compiler-construction fortran intel pgi

我们有一个项目可以发展Nvidia GPU和Intel Xeon Phi。主机代码和GPU代码用Fortran编写,由pgfortran编译。为了将我们的一些工作卸载到Phi,我们必须创建一个由ifort编译的共享库(静态链接不能工作),并从代码的pgfortran部分调用共享子例程。通过这样做,我们可以将代码的pgfortran部分中的数组卸载到可以与Xeon Phi通信的intel fortran共享库中。

现在我正在尝试将包含可分配数组的派生类型从代码的pgfortran部分传递给ifort共享库。看起来有一些问题。

这是一个简单的例子(这里没有Xeon Phi offload指令):

caller.f90:

program caller                                                                           

type cell                                                                                
integer :: id                                                                            
real, allocatable :: a(:)                                                                
real, allocatable :: b(:)                                                                
real, allocatable :: c(:)                                                                
end type cell                                                                            

integer :: n,i,j

type(cell) :: cl(2)                                                                      
 n=10                                                                                    
do i=1,2                                                                                 
allocate(cl(i)%a(n))                                                                     
allocate(cl(i)%b(n))                                                                     
allocate(cl(i)%c(n))                                                                     
end do                                                                                   


do j=1, 2                                                                                
do i=1, n                                                                                
cl(j)%a(i)=10*j+i                                                                        
cl(j)%b(i)=10*i+j                                                                        
end do                                                                                   
end do                                                                                   


call offload(cl(1))                                                                      
print *, cl(1)%c  
end program caller

called.f90:

subroutine  offload(cl)                                                                  
type cell                                                                                
integer :: id                                                                            
real, allocatable :: a(:)                                                                
real, allocatable :: b(:)                                                                
real, allocatable :: c(:)                                                                
end type cell

type(cell) :: cl                                                                         
integer :: n

print *, cl%a(1:10)
print *, cl%b(1:10)   
end subroutine offload    

生成文件:

run: caller.o libcalled.so
           pgfortran  -L. caller.o -lcalled  -o $@
caller.o: caller.f90
           pgfortran  -c caller.f90
libcalled.so: called.f90
           ifort  -shared -fPIC $^ -o $@

注意“cl%a(1:10)”,在“(1:10)”中没有任何内容打印出来。

此代码最终打印出cl(1)%a中的元素,然后在我尝试打印数组cl(1)%b的下一行中遇到分段错误。

如果我将“cl%a(1:10)”更改为“cl%a(1:100)”,则删除“print *, cl%b(1:10)”。它会产生以下结果:

results

我们可以发现b数组中的元素存在,但我无法通过“cl%b(1:10)”获取它们。

我知道这可能是由不同编译器的不同派生类型结构引起的。但我真的想要一种可以在编译器之间传递这种派生类型的方法。有解决方案吗

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

编译器的ABI可能不同。您不应该直接传递结构,而是在子例程中构建它们并使用指针,您应该将它们作为type(c_ptr)或假定的大小数组传递(但是可以发生复制!)。

与Fortran 2003中的C的互操作性并不仅仅意味着与C交互,而是与C可互操作的任何其他编译器。它可以是不同的Fortran编译器。

请注意,除非类型为sequencebind(C),否则在更多位置声明相同类型并将其用作相同类型是违反Fortran规则的。这是您的程序不符合标准的另一个原因。

called.f90:

subroutine  offload(cl_c)                                                                  
use iso_c_binding

type, bind(C) :: cell_C                                                                               
integer :: id                                                                            
integer :: na, nb, nc
type(c_ptr)  :: a,b,c                                                                                                                             
end type cell_C

type cell                                                                               
integer :: id
real, pointer :: a(:)                                                                
real, pointer :: b(:)                                                                
real, pointer :: c(:)                                                                
end type cell

type(cell) :: cl
type(cell_C) :: cl_C
integer :: n

cl%id = cl_C%id
call c_f_pointer(cl_C%a, cl%a, [cl_c%na])
call c_f_pointer(cl_C%b, cl%b, [cl_c%nb])
call c_f_pointer(cl_C%c, cl%c, [cl_c%nc])

print *, cl%a(1:10)
print *, cl%b(1:10)   
end subroutine offload  

caller.f90:

program caller
use iso_c_binding

type, bind(C) :: cell_C                                                                               
integer :: id                                                                            
integer :: na, nb, nc
type(c_ptr)  :: a,b,c                                                                                                                             
end type cell_C

type cell                                                                                
integer :: id                                                                            
real, allocatable :: a(:)                                                                
real, allocatable :: b(:)                                                                
real, allocatable :: c(:)                                                                
end type cell                                                                            

integer :: n,i,j

type(cell),target :: cl(2)
type(cell_c) :: cl_c
 n=10                                                                                    
do i=1,2                                                                                 
allocate(cl(i)%a(n))                                                                     
allocate(cl(i)%b(n))                                                                     
allocate(cl(i)%c(n))                                                                     
end do                                                                                   

do j=1, 2                                                                                
do i=1, n                                                                                
cl(j)%a(i)=10*j+i                                                                        
cl(j)%b(i)=10*i+j                                                                        
end do                                                                                   
end do                                                                                   

cl_c%a = c_loc(cl(1)%a)
cl_c%b = c_loc(cl(1)%b)
cl_c%c = c_loc(cl(1)%c)
cl_c%na =  size(cl(1)%a)
cl_c%nb =  size(cl(1)%b)
cl_c%nc =  size(cl(1)%c)
cl_c%id =  cl(1)%id

call offload(cl_c)                                                                      
print *, cl(1)%c  
end program caller

与gfortran和ifort:

>gfortran  called.f90 -c -o called.o
>ifort  caller.f90 -c -o caller.o
>ifort -o a.out called.o caller.o -lgfortran
>./a.out
11.0000000       12.0000000       13.0000000       14.0000000       15.0000000       16.0000000       17.0000000       18.0000000       19.0000000       20.0000000    
   11.0000000       21.0000000       31.0000000       41.0000000       51.0000000       61.0000000       71.0000000       81.0000000       91.0000000       101.000000    
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00
  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00  0.0000000E+00

此处不需要动态库。

对于100%的理论可移植性,可以使用c_intc_float,...格式化可能会更好等等,但您明白了。

您还可以重置cellcell_C之间的分配,以简化转换。