Python多处理map_async ready（）和_number_left无法按预期工作

时间：2013-11-14 06:26:45

标签： python multiprocessing

这有点复杂，我确信这是一个新手错误，但我不能为我的生活弄清楚哪里可以看。

尝试执行多处理map_async来处理大量文件。本质上，代码获取文件列表，在每个文件中查找MAC地址上的匹配项，如果匹配则将一行写入另一个文件。

nodb是我的图书馆....我还没有把所有东西都包括在内（这有点令人费解）。我希望有人可以指出我在哪里寻找调试。

问题在于：代码可以在60,000个文件下完美运行。但是，当我将它指向一个包含595,200个文件的目录时，检查它是否完成的小“while true”循环（使用_number_left）停止工作....处理似乎继续但_number_left没有减少并且ready（）函数返回TRUE ......它不是。

每次运行62111或62112文件后它都会停止。我添加了一个小“转储”功能，认为我的队列正在填满。

不确定还告诉你什么...我错过了什么吗？ （可能）请让我知道我能告诉你什么更多来解决这个问题。我真的不知道什么是相关的......

代码是：

import nodb_v09d as nodb

import netaddr
import sys
import collections
from multiprocessing import Pool, Queue
import itertools
import time

# Handle CLI arguments
#
nmultip = 1
args = sys.argv[1:]
nmultip = nodb.parseArgs(args)

# this function just gets the file list in the directory
todoPif = nodb.getFileList('/data/david/data/2012/05')

filterfields = { 10:set([int(netaddr.EUI('00-00-0a-0e-c9-be')),\
                         int(netaddr.EUI('00:15:ce:de:78:f3')),\
                         int(netaddr.EUI('3c-75-4a-ea-15-01')),\
                         int(netaddr.EUI('00-24-d1-1e-e9-be'))])
                 }
ff=collections.OrderedDict(sorted(filterfields.items()))

resultfields = [28,29,30,33]
rf=resultfields.sort

cutoff = 40

todocnt = len(todoPif)

outQ = Queue()
hdrQ = Queue()

# output file
gpif = '/media/sf_samplePifs/test2.gpif'

append = 0

if __name__ == '__main__':

    # this is a little trick I picked up off the internet for passing multiple queues.  works ok
    todopool = Pool(None,nodb.poolQueueInit,[outQ,hdrQ])

    # itertools used to create an arg that contains a constant (ff) for all calls)
    r = todopool.map_async(nodb.deRefCall,itertools.izip(todoPif, itertools.repeat(ff)),1)

    while (True):
        nodb.logging.info('number left: ' + str(r._number_left) + '\nready? ' + str(r.ready()))
        nodb.logging.info('queue size: ' + str(outQ.qsize()))

        if (r._number_left == 0): break
        if (outQ.qsize() >= cutoff):
            nodb.dumpQueueToGpif(gpif, hdrQ, outQ, append, cutoff)
            if (append == 0): 
                append = 1

        sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt-r._number_left) + '/' + str(todocnt))
        print '\n'
        time.sleep(0.2)
    r.wait()  

sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt) + '/' + str(todocnt) + '\n')

# dump remainder to file
nodb.dumpQueueToGpif(gpif, hdrQ, outQ, append,outQ.qsize())

主要补充：

应其他用户的要求，我简化了代码。没有队列，没有外部私人库等：

import sys
import os
import time
from multiprocessing import Pool

def doPifFile(pifFile):

    #readPif = call(['ls','-l',' > /tmp/out'])
    cmd = 'ipdr_dump ' + pifFile + ' | grep "," | wc -l > /tmp/dump'
    readPif = os.system(cmd)
    return readPif

def getFileList(directory):
    flist = list()
    for root, dirs, files in os.walk(directory):
        for piffile in files:
            if piffile.endswith('.pif'):
                flist.append(os.path.abspath(os.path.join(root,piffile)))
    return flist

todoPif = getFileList('/data/david/data/2012/05')

todocnt = len(todoPif)
print '# of files to process: ' + str(todocnt)

if __name__ == '__main__':

    todopool = Pool()
    r = todopool.map_async(doPifFile,todoPif,1)

    while (True):
        print 'number left: ' + str(r._number_left) + '\nready? ' + str(r.ready())

        #if (r.ready()): break
        if (r._number_left == 0): break
        sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt-r._number_left) + '/' + str(todocnt))
        print '\n'
        time.sleep(0.2)

sys.stderr.write('\rPIF Files DONE: ' + str(todocnt) + '/' + str(todocnt) + '\n')

当我运行它时，我得到了一些非常有趣的东西，它们没有出现在运行中的代码更复杂但是发生在完全相同的位置，尽管它声称它发生在我的转储程序中：

number left: 533100
ready? False
PIF Files DONE: 62100/595200

number left: 533090
ready? False
PIF Files DONE: 62110/595200

*** glibc detected *** ipdr_dump: corrupted double-linked list: 0x0000000001a58370 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6[0x36f5c76126]
/lib64/libc.so.6[0x36f5c78eb4]
/lib64/libc.so.6(fclose+0x14d)[0x36f5c6678d]
/lib64/libz.so.1[0x36f6803021]
ipdr_dump[0x405c0b]
ipdr_dump[0x40546e]
ipdr_dump[0x401c2a]
/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xfd)[0x36f5c1ecdd]
ipdr_dump[0x4016b9]
======= Memory map: ========
00400000-0040e000 r-xp 00000000 08:02 2364135                            /home/david/ipdr_dump
0060d000-0060e000 rw-p 0000d000 08:02 2364135                            /home/david/ipdr_dump
01a54000-01a75000 rw-p 00000000 00:00 0                                  [heap]
32e0600000-32e0604000 r-xp 00000000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
32e0604000-32e0803000 ---p 00004000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
32e0803000-32e0804000 rw-p 00003000 08:02 3932181                        /lib64/libuuid.so.1.3.0
36f5800000-36f5820000 r-xp 00000000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a1f000-36f5a20000 r--p 0001f000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a20000-36f5a21000 rw-p 00020000 08:02 3932309                        /lib64/ld-2.12.so
36f5a21000-36f5a22000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f5c00000-36f5d8a000 r-xp 00000000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5d8a000-36f5f89000 ---p 0018a000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f89000-36f5f8d000 r--p 00189000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f8d000-36f5f8e000 rw-p 0018d000 08:02 3932315                        /lib64/libc-2.12.so
36f5f8e000-36f5f93000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f6000000-36f6002000 r-xp 00000000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6002000-36f6202000 ---p 00002000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6202000-36f6203000 r--p 00002000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6203000-36f6204000 rw-p 00003000 08:02 3932566                        /lib64/libdl-2.12.so
36f6400000-36f6417000 r-xp 00000000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6417000-36f6617000 ---p 00017000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6617000-36f6618000 r--p 00017000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6618000-36f6619000 rw-p 00018000 08:02 3932564                        /lib64/libpthread-2.12.so
36f6619000-36f661d000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f6800000-36f6815000 r-xp 00000000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6815000-36f6a14000 ---p 00015000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6a14000-36f6a15000 r--p 00014000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6a15000-36f6a16000 rw-p 00015000 08:02 3932563                        /lib64/libz.so.1.2.3
36f6c00000-36f6c83000 r-xp 00000000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6c83000-36f6e82000 ---p 00083000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6e82000-36f6e83000 r--p 00082000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f6e83000-36f6e84000 rw-p 00083000 08:02 3932493                        /lib64/libm-2.12.so
36f7000000-36f7007000 r-xp 00000000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7007000-36f7206000 ---p 00007000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7206000-36f7207000 r--p 00006000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7207000-36f7208000 rw-p 00007000 08:02 3935994                        /lib64/librt-2.12.so
36f7800000-36f781d000 r-xp 00000000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f781d000-36f7a1c000 ---p 0001d000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1c000-36f7a1d000 r--p 0001c000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1d000-36f7a1e000 rw-p 0001d000 08:02 3932588                        /lib64/libselinux.so.1
36f7a1e000-36f7a1f000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f7c00000-36f7c16000 r-xp 00000000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7c16000-36f7e16000 ---p 00016000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e16000-36f7e17000 r--p 00016000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e17000-36f7e18000 rw-p 00017000 08:02 3932572                        /lib64/libresolv-2.12.so
36f7e18000-36f7e1a000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f8000000-36f800e000 r-xp 00000000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f800e000-36f820d000 ---p 0000e000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f820d000-36f820e000 r--p 0000d000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f820e000-36f820f000 rw-p 0000e000 08:02 3935998                        /lib64/liblber-2.4.so.2.5.6
36f8800000-36f8849000 r-xp 00000000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8849000-36f8a49000 ---p 00049000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8a49000-36f8a4b000 r--p 00049000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8a4b000-36f8a4d000 rw-p 0004b000 08:02 3932243                        /lib64/libldap-2.4.so.2.5.6
36f8c00000-36f8c16000 r-xp 00000000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f8c16000-36f8e15000 ---p 00016000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f8e15000-36f8e16000 rw-p 00015000 08:02 3936000                        /lib64/libgcc_s-4.4.7-20120601.so.1
36f9400000-36f9535000 r-xp 00000000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9535000-36f9734000 ---p 00135000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9734000-36f9739000 r--p 00134000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f9739000-36f973b000 rw-p 00139000 08:02 4206136                        /usr/lib64/libnss3.so
36f973b000-36f973d000 rw-p 00000000 00:00 0 
36f9800000-36f9825000 r-xp 00000000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.so
36f9825000-36f9a24000 ---p 00025000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.so
36f9a24000-36f9a2a000 r--p 00024000 08:02 4206135                        /usr/lib64/libnssutil3.sonumber left: 533078
ready? False
PIF Files DONE: 62122/595200

number left: 533068
ready? False
PIF Files DONE: 62132/595200

number left: 533056
ready? False
PIF Files DONE: 62144/595200

奇怪的是，它继续运行，而之前的运行导致_number_left失败并且“ready（）”失败（尽管进程仍然在后台运行）。

我已经在我拥有的16处理器盒上手动运行转储程序，它们并行运行良好，以前从未见过glibc错误。我必须假设它与python设置有关....我只是不知道在哪里。

对于论坛诊断而言，这可能过于复杂。

。欢迎任何有关我可能会在哪里或我如何能够看到发生的事情的进一步想法。

还有一个小问题...打印出来的pool._success。当_number_left停止移动时，它会在神奇时刻变为FALSE。 

INFO  number left: 533167  
ready? False  
successful? True  
INFO  queue size: 424  
PIF Files DONE: 62033/595200  

INFO  number left: 533117
ready? False
successful? True
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62083/595200

INFO  number left: 533087
ready? True
successful? False
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62113/595200

INFO  number left: 533087
ready? True
successful? False
INFO  queue size: 424
PIF Files DONE: 62113/595200

2 个答案:

答案 0 :(得分：1)

经过多次努力，我发现了问题......至于导致问题的原因，我还说不出来。看起来像个bug。

这里有几个高级命令，所以我接下来解释的更有意义（这不是可执行的）：

todopool = Pool()

r = todopool.map_async(myfunction,args,1)

print type(r._value)

回想一下，args是一个包含595,200个文件名的列表。

我开始查看r._value，在我的例子中是一个长度为595,200的列表。我注意到问题出现的时候，价值发生了变化......所以我查看了类型。

以下是我最近一次运行的输出：

INFO  number left: 533148 <- based on r._number_left
<type 'list'>             <- print type(r._value)
PIF Files DONE: 62052/595200

INFO  number left: 533096
<type 'list'>
PIF Files DONE: 62104/595200

INFO  number left: 533087
<class 'nodb_v09e.pifReaderEOFReached'>
PIF Files DONE: 62113/595200

INFO  number left: 533087
<class 'nodb_v09e.pifReaderEOFReached'>
PIF Files DONE: 62113/595200

突然r._value，这是一个长度为595,200的列表，现在是一个例外类。奇怪的是，每次运行我的子程序都会以该异常结束，所以这个特定的运行与其他任何运行没有什么不同......这就是我告诉我在文件末尾的方式。

将r._value从列表更改为类是什么搞砸_number_left和我的结果反馈显示。为什么这样做尚未确定。

答案 1 :(得分：0)

您可以尝试使用sys.stdout.flush（）。

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